Protein–RNA interactions for Protein: Q15907

RAB11B, Ras-related protein Rab-11B, humanhuman

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11BQ15907 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB11BQ15907 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB11BQ15907 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB11BQ15907 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB11BQ15907 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB11BQ15907 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB11BQ15907 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB11BQ15907 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB11BQ15907 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB11BQ15907 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11BQ15907 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB11BQ15907 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB11BQ15907 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB11BQ15907 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB11BQ15907 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB11BQ15907 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB11BQ15907 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB11BQ15907 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB11BQ15907 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB11BQ15907 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB11BQ15907 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB11BQ15907 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB11BQ15907 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB11BQ15907 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB11BQ15907 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB11BQ15907 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB11BQ15907 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB11BQ15907 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB11BQ15907 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB11BQ15907 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB11BQ15907 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB11BQ15907 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB11BQ15907 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB11BQ15907 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB11BQ15907 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB11BQ15907 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB11BQ15907 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB11BQ15907 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB11BQ15907 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB11BQ15907 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB11BQ15907 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB11BQ15907 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RAB11BQ15907 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB11BQ15907 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB11BQ15907 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB11BQ15907 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB11BQ15907 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB11BQ15907 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB11BQ15907 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB11BQ15907 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB11BQ15907 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB11BQ15907 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB11BQ15907 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB11BQ15907 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB11BQ15907 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB11BQ15907 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB11BQ15907 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB11BQ15907 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB11BQ15907 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB11BQ15907 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB11BQ15907 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB11BQ15907 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB11BQ15907 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB11BQ15907 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RAB11BQ15907 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB11BQ15907 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB11BQ15907 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB11BQ15907 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB11BQ15907 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB11BQ15907 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB11BQ15907 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB11BQ15907 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB11BQ15907 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB11BQ15907 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB11BQ15907 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB11BQ15907 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB11BQ15907 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB11BQ15907 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB11BQ15907 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB11BQ15907 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB11BQ15907 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB11BQ15907 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB11BQ15907 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB11BQ15907 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB11BQ15907 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB11BQ15907 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB11BQ15907 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB11BQ15907 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB11BQ15907 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB11BQ15907 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB11BQ15907 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB11BQ15907 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB11BQ15907 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB11BQ15907 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB11BQ15907 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB11BQ15907 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB11BQ15907 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB11BQ15907 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB11BQ15907 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB11BQ15907 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
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