Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEDD8Q15843 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEDD8Q15843 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEDD8Q15843 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEDD8Q15843 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEDD8Q15843 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEDD8Q15843 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEDD8Q15843 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEDD8Q15843 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEDD8Q15843 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEDD8Q15843 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEDD8Q15843 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEDD8Q15843 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEDD8Q15843 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEDD8Q15843 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEDD8Q15843 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEDD8Q15843 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEDD8Q15843 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEDD8Q15843 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEDD8Q15843 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEDD8Q15843 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEDD8Q15843 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEDD8Q15843 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEDD8Q15843 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEDD8Q15843 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEDD8Q15843 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEDD8Q15843 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEDD8Q15843 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEDD8Q15843 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEDD8Q15843 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEDD8Q15843 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEDD8Q15843 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEDD8Q15843 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEDD8Q15843 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEDD8Q15843 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEDD8Q15843 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEDD8Q15843 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEDD8Q15843 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEDD8Q15843 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEDD8Q15843 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NEDD8Q15843 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEDD8Q15843 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD8Q15843 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEDD8Q15843 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEDD8Q15843 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD8Q15843 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD8Q15843 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEDD8Q15843 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEDD8Q15843 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEDD8Q15843 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEDD8Q15843 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEDD8Q15843 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEDD8Q15843 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEDD8Q15843 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEDD8Q15843 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEDD8Q15843 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEDD8Q15843 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEDD8Q15843 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEDD8Q15843 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEDD8Q15843 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEDD8Q15843 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEDD8Q15843 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEDD8Q15843 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEDD8Q15843 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEDD8Q15843 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEDD8Q15843 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEDD8Q15843 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEDD8Q15843 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEDD8Q15843 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEDD8Q15843 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEDD8Q15843 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEDD8Q15843 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEDD8Q15843 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEDD8Q15843 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEDD8Q15843 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEDD8Q15843 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEDD8Q15843 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEDD8Q15843 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEDD8Q15843 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEDD8Q15843 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEDD8Q15843 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEDD8Q15843 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEDD8Q15843 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEDD8Q15843 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEDD8Q15843 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEDD8Q15843 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEDD8Q15843 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NEDD8Q15843 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEDD8Q15843 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEDD8Q15843 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEDD8Q15843 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEDD8Q15843 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEDD8Q15843 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NEDD8Q15843 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEDD8Q15843 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEDD8Q15843 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEDD8Q15843 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEDD8Q15843 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEDD8Q15843 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEDD8Q15843 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms