Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
SHPRHQ149N8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
SHPRHQ149N8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
SHPRHQ149N8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
SHPRHQ149N8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC39.45■■■■□ 3.91
SHPRHQ149N8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
SHPRHQ149N8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
SHPRHQ149N8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
SHPRHQ149N8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
SHPRHQ149N8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
SHPRHQ149N8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC39.4■■■■□ 3.9
SHPRHQ149N8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.9
SHPRHQ149N8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
SHPRHQ149N8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
SHPRHQ149N8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
SHPRHQ149N8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
SHPRHQ149N8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
SHPRHQ149N8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
SHPRHQ149N8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
SHPRHQ149N8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
SHPRHQ149N8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
SHPRHQ149N8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
SHPRHQ149N8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
SHPRHQ149N8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
SHPRHQ149N8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC39.16■■■■□ 3.86
SHPRHQ149N8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
SHPRHQ149N8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.86
SHPRHQ149N8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.86
SHPRHQ149N8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
SHPRHQ149N8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
SHPRHQ149N8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC39.09■■■■□ 3.85
SHPRHQ149N8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
SHPRHQ149N8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
SHPRHQ149N8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC39.08■■■■□ 3.85
SHPRHQ149N8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
SHPRHQ149N8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
SHPRHQ149N8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.06■■■■□ 3.84
SHPRHQ149N8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
SHPRHQ149N8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC39.03■■■■□ 3.84
SHPRHQ149N8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
SHPRHQ149N8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
SHPRHQ149N8 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
SHPRHQ149N8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
SHPRHQ149N8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
SHPRHQ149N8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
SHPRHQ149N8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
SHPRHQ149N8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
SHPRHQ149N8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
SHPRHQ149N8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
SHPRHQ149N8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC38.89■■■■□ 3.82
SHPRHQ149N8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC38.88■■■■□ 3.82
SHPRHQ149N8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
SHPRHQ149N8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
SHPRHQ149N8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
SHPRHQ149N8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
SHPRHQ149N8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
SHPRHQ149N8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
SHPRHQ149N8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
SHPRHQ149N8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
SHPRHQ149N8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
SHPRHQ149N8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
SHPRHQ149N8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC38.77■■■■□ 3.8
SHPRHQ149N8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
SHPRHQ149N8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
SHPRHQ149N8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC38.76■■■■□ 3.8
SHPRHQ149N8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
SHPRHQ149N8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.74■■■■□ 3.79
SHPRHQ149N8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
SHPRHQ149N8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
SHPRHQ149N8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
SHPRHQ149N8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
SHPRHQ149N8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
SHPRHQ149N8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC38.7■■■■□ 3.79
SHPRHQ149N8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
SHPRHQ149N8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
SHPRHQ149N8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
SHPRHQ149N8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
SHPRHQ149N8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
SHPRHQ149N8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC38.66■■■■□ 3.78
SHPRHQ149N8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
SHPRHQ149N8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
SHPRHQ149N8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
SHPRHQ149N8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
SHPRHQ149N8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
SHPRHQ149N8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
SHPRHQ149N8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
SHPRHQ149N8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
SHPRHQ149N8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC38.59■■■■□ 3.77
SHPRHQ149N8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
SHPRHQ149N8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
SHPRHQ149N8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
SHPRHQ149N8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
SHPRHQ149N8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
SHPRHQ149N8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.76
SHPRHQ149N8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
SHPRHQ149N8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
SHPRHQ149N8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
SHPRHQ149N8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
SHPRHQ149N8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
SHPRHQ149N8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms