Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
BECN1Q14457 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
BECN1Q14457 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
BECN1Q14457 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
BECN1Q14457 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
BECN1Q14457 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
BECN1Q14457 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
BECN1Q14457 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
BECN1Q14457 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
BECN1Q14457 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
BECN1Q14457 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
BECN1Q14457 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
BECN1Q14457 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
BECN1Q14457 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
BECN1Q14457 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
BECN1Q14457 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
BECN1Q14457 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
BECN1Q14457 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
BECN1Q14457 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
BECN1Q14457 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
BECN1Q14457 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
BECN1Q14457 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
BECN1Q14457 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
BECN1Q14457 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
BECN1Q14457 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
BECN1Q14457 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
BECN1Q14457 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
BECN1Q14457 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
BECN1Q14457 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
BECN1Q14457 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
BECN1Q14457 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
BECN1Q14457 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
BECN1Q14457 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
BECN1Q14457 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
BECN1Q14457 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
BECN1Q14457 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
BECN1Q14457 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
BECN1Q14457 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
BECN1Q14457 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
BECN1Q14457 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
BECN1Q14457 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
BECN1Q14457 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
BECN1Q14457 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
BECN1Q14457 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
BECN1Q14457 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
BECN1Q14457 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
BECN1Q14457 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
BECN1Q14457 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
BECN1Q14457 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
BECN1Q14457 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
BECN1Q14457 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
BECN1Q14457 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
BECN1Q14457 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
BECN1Q14457 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
BECN1Q14457 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
BECN1Q14457 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
BECN1Q14457 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
BECN1Q14457 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
BECN1Q14457 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
BECN1Q14457 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
BECN1Q14457 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
BECN1Q14457 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
BECN1Q14457 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
BECN1Q14457 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.89
BECN1Q14457 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
BECN1Q14457 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
BECN1Q14457 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
BECN1Q14457 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
BECN1Q14457 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
BECN1Q14457 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
BECN1Q14457 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
BECN1Q14457 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
BECN1Q14457 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
BECN1Q14457 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
BECN1Q14457 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
BECN1Q14457 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
BECN1Q14457 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
BECN1Q14457 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
BECN1Q14457 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
BECN1Q14457 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
BECN1Q14457 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
BECN1Q14457 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
BECN1Q14457 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
BECN1Q14457 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
BECN1Q14457 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
BECN1Q14457 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
BECN1Q14457 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
BECN1Q14457 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
BECN1Q14457 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
BECN1Q14457 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
BECN1Q14457 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
BECN1Q14457 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
BECN1Q14457 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
BECN1Q14457 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
BECN1Q14457 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
BECN1Q14457 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
BECN1Q14457 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
BECN1Q14457 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
BECN1Q14457 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
BECN1Q14457 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms