Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBE2V1Q13404 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBE2V1Q13404 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE2V1Q13404 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
UBE2V1Q13404 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE2V1Q13404 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE2V1Q13404 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE2V1Q13404 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE2V1Q13404 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE2V1Q13404 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE2V1Q13404 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBE2V1Q13404 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBE2V1Q13404 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBE2V1Q13404 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBE2V1Q13404 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBE2V1Q13404 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBE2V1Q13404 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBE2V1Q13404 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBE2V1Q13404 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBE2V1Q13404 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
UBE2V1Q13404 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
UBE2V1Q13404 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBE2V1Q13404 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBE2V1Q13404 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBE2V1Q13404 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBE2V1Q13404 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBE2V1Q13404 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBE2V1Q13404 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
UBE2V1Q13404 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
UBE2V1Q13404 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
UBE2V1Q13404 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
UBE2V1Q13404 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
UBE2V1Q13404 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBE2V1Q13404 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBE2V1Q13404 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE2V1Q13404 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE2V1Q13404 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE2V1Q13404 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE2V1Q13404 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE2V1Q13404 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBE2V1Q13404 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBE2V1Q13404 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBE2V1Q13404 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBE2V1Q13404 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE2V1Q13404 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE2V1Q13404 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE2V1Q13404 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE2V1Q13404 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE2V1Q13404 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE2V1Q13404 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE2V1Q13404 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBE2V1Q13404 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBE2V1Q13404 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
UBE2V1Q13404 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE2V1Q13404 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE2V1Q13404 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE2V1Q13404 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE2V1Q13404 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE2V1Q13404 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE2V1Q13404 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE2V1Q13404 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE2V1Q13404 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBE2V1Q13404 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
UBE2V1Q13404 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
UBE2V1Q13404 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
UBE2V1Q13404 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
UBE2V1Q13404 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
UBE2V1Q13404 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
UBE2V1Q13404 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
UBE2V1Q13404 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
UBE2V1Q13404 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
UBE2V1Q13404 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
UBE2V1Q13404 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
UBE2V1Q13404 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
UBE2V1Q13404 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
UBE2V1Q13404 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
UBE2V1Q13404 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE2V1Q13404 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE2V1Q13404 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE2V1Q13404 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE2V1Q13404 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE2V1Q13404 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE2V1Q13404 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE2V1Q13404 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE2V1Q13404 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE2V1Q13404 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE2V1Q13404 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE2V1Q13404 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE2V1Q13404 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE2V1Q13404 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE2V1Q13404 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE2V1Q13404 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
UBE2V1Q13404 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
UBE2V1Q13404 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBE2V1Q13404 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBE2V1Q13404 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBE2V1Q13404 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBE2V1Q13404 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE2V1Q13404 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE2V1Q13404 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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