Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IFT88Q13099 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IFT88Q13099 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IFT88Q13099 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFT88Q13099 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFT88Q13099 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFT88Q13099 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFT88Q13099 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IFT88Q13099 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
IFT88Q13099 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IFT88Q13099 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IFT88Q13099 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IFT88Q13099 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IFT88Q13099 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFT88Q13099 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFT88Q13099 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFT88Q13099 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IFT88Q13099 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IFT88Q13099 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IFT88Q13099 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IFT88Q13099 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IFT88Q13099 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IFT88Q13099 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IFT88Q13099 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IFT88Q13099 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IFT88Q13099 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
IFT88Q13099 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
IFT88Q13099 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
IFT88Q13099 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IFT88Q13099 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFT88Q13099 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFT88Q13099 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFT88Q13099 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFT88Q13099 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFT88Q13099 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IFT88Q13099 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IFT88Q13099 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IFT88Q13099 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
IFT88Q13099 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IFT88Q13099 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFT88Q13099 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFT88Q13099 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IFT88Q13099 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFT88Q13099 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFT88Q13099 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFT88Q13099 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFT88Q13099 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFT88Q13099 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFT88Q13099 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
IFT88Q13099 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFT88Q13099 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFT88Q13099 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFT88Q13099 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFT88Q13099 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IFT88Q13099 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
IFT88Q13099 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
IFT88Q13099 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
IFT88Q13099 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
IFT88Q13099 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFT88Q13099 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFT88Q13099 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFT88Q13099 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFT88Q13099 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFT88Q13099 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFT88Q13099 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFT88Q13099 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IFT88Q13099 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IFT88Q13099 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IFT88Q13099 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IFT88Q13099 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
IFT88Q13099 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFT88Q13099 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT88Q13099 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT88Q13099 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT88Q13099 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFT88Q13099 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFT88Q13099 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFT88Q13099 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IFT88Q13099 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFT88Q13099 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IFT88Q13099 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IFT88Q13099 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFT88Q13099 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFT88Q13099 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT88Q13099 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT88Q13099 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT88Q13099 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFT88Q13099 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFT88Q13099 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFT88Q13099 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFT88Q13099 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFT88Q13099 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFT88Q13099 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFT88Q13099 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT88Q13099 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT88Q13099 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT88Q13099 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT88Q13099 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFT88Q13099 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFT88Q13099 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
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