Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB40BQ12829 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB40BQ12829 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB40BQ12829 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB40BQ12829 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB40BQ12829 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB40BQ12829 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB40BQ12829 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB40BQ12829 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB40BQ12829 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RAB40BQ12829 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB40BQ12829 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB40BQ12829 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB40BQ12829 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB40BQ12829 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB40BQ12829 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB40BQ12829 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB40BQ12829 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB40BQ12829 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAB40BQ12829 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB40BQ12829 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB40BQ12829 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB40BQ12829 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB40BQ12829 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB40BQ12829 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB40BQ12829 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB40BQ12829 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB40BQ12829 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB40BQ12829 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB40BQ12829 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB40BQ12829 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB40BQ12829 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB40BQ12829 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB40BQ12829 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB40BQ12829 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB40BQ12829 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB40BQ12829 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB40BQ12829 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB40BQ12829 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB40BQ12829 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB40BQ12829 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB40BQ12829 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB40BQ12829 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB40BQ12829 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB40BQ12829 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB40BQ12829 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB40BQ12829 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB40BQ12829 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB40BQ12829 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB40BQ12829 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB40BQ12829 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB40BQ12829 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB40BQ12829 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB40BQ12829 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB40BQ12829 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB40BQ12829 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB40BQ12829 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB40BQ12829 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB40BQ12829 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB40BQ12829 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB40BQ12829 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB40BQ12829 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB40BQ12829 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB40BQ12829 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB40BQ12829 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB40BQ12829 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB40BQ12829 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB40BQ12829 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB40BQ12829 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB40BQ12829 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB40BQ12829 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB40BQ12829 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB40BQ12829 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB40BQ12829 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB40BQ12829 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB40BQ12829 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB40BQ12829 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB40BQ12829 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB40BQ12829 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB40BQ12829 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB40BQ12829 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB40BQ12829 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB40BQ12829 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB40BQ12829 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB40BQ12829 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB40BQ12829 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB40BQ12829 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB40BQ12829 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB40BQ12829 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB40BQ12829 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB40BQ12829 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB40BQ12829 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RAB40BQ12829 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB40BQ12829 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB40BQ12829 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB40BQ12829 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB40BQ12829 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB40BQ12829 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB40BQ12829 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB40BQ12829 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
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