Protein–RNA interactions for Protein: Q0P140

HSD52, Putative uncharacterized protein HSD52, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD52Q0P140 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HSD52Q0P140 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
HSD52Q0P140 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HSD52Q0P140 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HSD52Q0P140 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HSD52Q0P140 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HSD52Q0P140 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HSD52Q0P140 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HSD52Q0P140 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HSD52Q0P140 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HSD52Q0P140 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HSD52Q0P140 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HSD52Q0P140 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HSD52Q0P140 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HSD52Q0P140 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HSD52Q0P140 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HSD52Q0P140 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HSD52Q0P140 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HSD52Q0P140 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HSD52Q0P140 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HSD52Q0P140 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HSD52Q0P140 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HSD52Q0P140 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSD52Q0P140 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HSD52Q0P140 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HSD52Q0P140 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HSD52Q0P140 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HSD52Q0P140 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HSD52Q0P140 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HSD52Q0P140 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HSD52Q0P140 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HSD52Q0P140 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HSD52Q0P140 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HSD52Q0P140 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HSD52Q0P140 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HSD52Q0P140 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HSD52Q0P140 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HSD52Q0P140 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HSD52Q0P140 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HSD52Q0P140 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HSD52Q0P140 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HSD52Q0P140 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HSD52Q0P140 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HSD52Q0P140 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HSD52Q0P140 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HSD52Q0P140 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HSD52Q0P140 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HSD52Q0P140 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HSD52Q0P140 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HSD52Q0P140 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HSD52Q0P140 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HSD52Q0P140 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
HSD52Q0P140 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
HSD52Q0P140 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HSD52Q0P140 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HSD52Q0P140 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HSD52Q0P140 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HSD52Q0P140 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HSD52Q0P140 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HSD52Q0P140 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HSD52Q0P140 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HSD52Q0P140 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSD52Q0P140 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSD52Q0P140 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSD52Q0P140 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSD52Q0P140 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSD52Q0P140 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSD52Q0P140 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSD52Q0P140 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSD52Q0P140 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSD52Q0P140 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSD52Q0P140 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HSD52Q0P140 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HSD52Q0P140 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HSD52Q0P140 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HSD52Q0P140 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HSD52Q0P140 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HSD52Q0P140 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HSD52Q0P140 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HSD52Q0P140 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HSD52Q0P140 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HSD52Q0P140 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HSD52Q0P140 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HSD52Q0P140 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HSD52Q0P140 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HSD52Q0P140 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HSD52Q0P140 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSD52Q0P140 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSD52Q0P140 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSD52Q0P140 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSD52Q0P140 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSD52Q0P140 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSD52Q0P140 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSD52Q0P140 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HSD52Q0P140 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HSD52Q0P140 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HSD52Q0P140 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HSD52Q0P140 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HSD52Q0P140 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HSD52Q0P140 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms