Protein–RNA interactions for Protein: Q05510

YDR344C, Uncharacterized protein YDR344C, yeastyeast

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YDR344CQ05510 AST1YBL069W 1290 nt11.69□□□□□ -0.54
YDR344CQ05510 YFR018CYFR018C 1092 nt11.66□□□□□ -0.54
YDR344CQ05510 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.65□□□□□ -0.54
YDR344CQ05510 URE2YNL229C 1065 nt11.65□□□□□ -0.54
YDR344CQ05510 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt11.63□□□□□ -0.55
YDR344CQ05510 PEX27YOR193W 1131 nt11.63□□□□□ -0.55
YDR344CQ05510 URH1YDR400W 1023 nt11.62□□□□□ -0.55
YDR344CQ05510 LCP5YER127W 1074 nt11.62□□□□□ -0.55
YDR344CQ05510 CWP1YKL096W 720 nt11.62□□□□□ -0.55
YDR344CQ05510 TIM23YNR017W 669 nt11.6□□□□□ -0.55
YDR344CQ05510 PRE6YOL038W 765 nt11.6□□□□□ -0.55
YDR344CQ05510 STD1YOR047C 1335 nt11.6□□□□□ -0.55
YDR344CQ05510 CLB6YGR109C 1143 nt11.58□□□□□ -0.56
YDR344CQ05510 FMP52YER004W 696 nt11.56□□□□□ -0.56
YDR344CQ05510 MET8YBR213W 825 nt11.56□□□□□ -0.56
YDR344CQ05510 DCW1YKL046C 1350 nt11.55□□□□□ -0.56
YDR344CQ05510 DIC1YLR348C 897 nt11.55□□□□□ -0.56
YDR344CQ05510 CUE1YMR264W 612 nt11.55□□□□□ -0.56
YDR344CQ05510 SNF6YHL025W 999 nt11.54□□□□□ -0.56
YDR344CQ05510 YLR179CYLR179C 606 nt11.53□□□□□ -0.56
YDR344CQ05510 ADH2YMR303C 1047 nt11.53□□□□□ -0.56
YDR344CQ05510 FAR3YMR052W 615 nt11.51□□□□□ -0.57
YDR344CQ05510 YPR064WYPR064W 420 nt11.5□□□□□ -0.57
YDR344CQ05510 YIL100WYIL100W 354 nt11.47□□□□□ -0.57
YDR344CQ05510 IRC15YPL017C 1500 nt11.46□□□□□ -0.57
YDR344CQ05510 YDR008CYDR008C 351 nt11.46□□□□□ -0.57
YDR344CQ05510 RPM1RPM1 483 nt11.46□□□□□ -0.57
YDR344CQ05510 EMI2YDR516C 1503 nt11.45□□□□□ -0.58
YDR344CQ05510 MPS2YGL075C 1164 nt11.45□□□□□ -0.58
YDR344CQ05510 GTT3YEL017W 1014 nt11.44□□□□□ -0.58
YDR344CQ05510 YJL107CYJL107C 1164 nt11.44□□□□□ -0.58
YDR344CQ05510 TAD3YLR316C 969 nt11.43□□□□□ -0.58
YDR344CQ05510 NAT4YMR069W 858 nt11.42□□□□□ -0.58
YDR344CQ05510 FTR1YER145C 1215 nt11.41□□□□□ -0.58
YDR344CQ05510 RSM23YGL129C 1353 nt11.41□□□□□ -0.58
YDR344CQ05510 YDL221WYDL221W 552 nt11.4□□□□□ -0.58
YDR344CQ05510 YFL066CYFL066C 1179 nt11.39□□□□□ -0.59
YDR344CQ05510 GIS3YLR094C 1509 nt11.39□□□□□ -0.59
YDR344CQ05510 YHM2YMR241W 945 nt11.38□□□□□ -0.59
YDR344CQ05510 YMR090WYMR090W 684 nt11.36□□□□□ -0.59
YDR344CQ05510 PCM1YEL058W 1674 nt11.36□□□□□ -0.59
YDR344CQ05510 SPT5YML010W 3192 nt11.35□□□□□ -0.59
YDR344CQ05510 GLK1YCL040W 1503 nt11.35□□□□□ -0.59
YDR344CQ05510 LSM12YHR121W 564 nt11.34□□□□□ -0.59
YDR344CQ05510 YLR036CYLR036C 612 nt11.34□□□□□ -0.59
YDR344CQ05510 YEL074WYEL074W 339 nt11.33□□□□□ -0.6
YDR344CQ05510 PEX25YPL112C 1185 nt11.33□□□□□ -0.6
YDR344CQ05510 WSC2YNL283C 1512 nt11.33□□□□□ -0.6
YDR344CQ05510 RNQ1YCL028W 1218 nt11.32□□□□□ -0.6
YDR344CQ05510 AHT1YHR093W 549 nt11.31□□□□□ -0.6
YDR344CQ05510 THP3YPR045C 1413 nt11.29□□□□□ -0.6
YDR344CQ05510 HAS1YMR290C 1518 nt11.29□□□□□ -0.6
YDR344CQ05510 YIH1YCR059C 777 nt11.27□□□□□ -0.61
YDR344CQ05510 PUS9YDL036C 1389 nt11.27□□□□□ -0.61
YDR344CQ05510 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt11.26□□□□□ -0.61
YDR344CQ05510 UBC12YLR306W 567 nt11.24□□□□□ -0.61
YDR344CQ05510 MSF1YPR047W 1410 nt11.23□□□□□ -0.61
YDR344CQ05510 YNL115CYNL115C 1935 nt11.23□□□□□ -0.61
YDR344CQ05510 SKI6YGR195W 741 nt11.22□□□□□ -0.61
YDR344CQ05510 COX3Q0275 810 nt11.22□□□□□ -0.61
YDR344CQ05510 IRC14YOR135C 342 nt11.22□□□□□ -0.61
YDR344CQ05510 YJL118WYJL118W 660 nt11.2□□□□□ -0.62
YDR344CQ05510 ARC19YKL013C 516 nt11.2□□□□□ -0.62
YDR344CQ05510 YLR415CYLR415C 339 nt11.19□□□□□ -0.62
YDR344CQ05510 YML079WYML079W 606 nt11.19□□□□□ -0.62
YDR344CQ05510 IDI1YPL117C 867 nt11.19□□□□□ -0.62
YDR344CQ05510 SCC4YER147C 1875 nt11.19□□□□□ -0.62
YDR344CQ05510 YSC84YHR016C 1407 nt11.18□□□□□ -0.62
YDR344CQ05510 YSP3YOR003W 1437 nt11.18□□□□□ -0.62
YDR344CQ05510 YNL040WYNL040W 1371 nt11.18□□□□□ -0.62
YDR344CQ05510 YHR054CYHR054C 1065 nt11.18□□□□□ -0.62
YDR344CQ05510 CUS2YNL286W 858 nt11.18□□□□□ -0.62
YDR344CQ05510 THI74YDR438W 1113 nt11.17□□□□□ -0.62
YDR344CQ05510 MPC1YGL080W 393 nt11.17□□□□□ -0.62
YDR344CQ05510 BDH1YAL060W 1149 nt11.17□□□□□ -0.62
YDR344CQ05510 AQY1YPR192W 918 nt11.17□□□□□ -0.62
YDR344CQ05510 YLL053CYLL053C 459 nt11.16□□□□□ -0.62
YDR344CQ05510 YMR244WYMR244W 1068 nt11.16□□□□□ -0.62
YDR344CQ05510 YNL195CYNL195C 786 nt11.14□□□□□ -0.63
YDR344CQ05510 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt11.13□□□□□ -0.63
YDR344CQ05510 SDH1YKL148C 1923 nt11.13□□□□□ -0.63
YDR344CQ05510 YPR1YDR368W 939 nt11.12□□□□□ -0.63
YDR344CQ05510 MIR1YJR077C 936 nt11.11□□□□□ -0.63
YDR344CQ05510 MOD5YOR274W 1287 nt11.11□□□□□ -0.63
YDR344CQ05510 YGL118CYGL118C 438 nt11.1□□□□□ -0.63
YDR344CQ05510 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt11.1□□□□□ -0.63
YDR344CQ05510 GAL1YBR020W 1587 nt11.08□□□□□ -0.64
YDR344CQ05510 YGR011WYGR011W 327 nt11.08□□□□□ -0.64
YDR344CQ05510 GLR1YPL091W 1452 nt11.07□□□□□ -0.64
YDR344CQ05510 SED5YLR026C 1023 nt11.06□□□□□ -0.64
YDR344CQ05510 RSA3YLR221C 663 nt11.06□□□□□ -0.64
YDR344CQ05510 TSR2YLR435W 618 nt11.06□□□□□ -0.64
YDR344CQ05510 BIO4YNR057C 714 nt11.06□□□□□ -0.64
YDR344CQ05510 TRM5YHR070W 1500 nt11.05□□□□□ -0.64
YDR344CQ05510 YHP1YDR451C 1062 nt11.05□□□□□ -0.64
YDR344CQ05510 NEJ1YLR265C 1029 nt11.05□□□□□ -0.64
YDR344CQ05510 RUF21RUF21 707 nt11.05□□□□□ -0.64
YDR344CQ05510 STB1YNL309W 1263 nt11.05□□□□□ -0.64
YDR344CQ05510 ZTA1YBR046C 1005 nt11.05□□□□□ -0.64
YDR344CQ05510 CCT4YDL143W 1587 nt11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.4 ms