Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRB3Q04118 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRB3Q04118 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRB3Q04118 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRB3Q04118 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRB3Q04118 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRB3Q04118 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRB3Q04118 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRB3Q04118 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRB3Q04118 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRB3Q04118 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRB3Q04118 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRB3Q04118 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRB3Q04118 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PRB3Q04118 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRB3Q04118 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRB3Q04118 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRB3Q04118 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRB3Q04118 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRB3Q04118 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRB3Q04118 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRB3Q04118 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRB3Q04118 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRB3Q04118 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRB3Q04118 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRB3Q04118 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRB3Q04118 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRB3Q04118 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRB3Q04118 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRB3Q04118 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRB3Q04118 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRB3Q04118 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRB3Q04118 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRB3Q04118 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRB3Q04118 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRB3Q04118 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRB3Q04118 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRB3Q04118 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRB3Q04118 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRB3Q04118 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRB3Q04118 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRB3Q04118 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRB3Q04118 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRB3Q04118 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRB3Q04118 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRB3Q04118 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRB3Q04118 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRB3Q04118 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRB3Q04118 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRB3Q04118 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRB3Q04118 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRB3Q04118 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRB3Q04118 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRB3Q04118 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRB3Q04118 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRB3Q04118 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRB3Q04118 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRB3Q04118 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRB3Q04118 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRB3Q04118 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRB3Q04118 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRB3Q04118 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRB3Q04118 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRB3Q04118 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PRB3Q04118 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRB3Q04118 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRB3Q04118 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRB3Q04118 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRB3Q04118 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRB3Q04118 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRB3Q04118 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRB3Q04118 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRB3Q04118 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRB3Q04118 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRB3Q04118 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRB3Q04118 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRB3Q04118 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRB3Q04118 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRB3Q04118 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRB3Q04118 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRB3Q04118 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRB3Q04118 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRB3Q04118 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRB3Q04118 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRB3Q04118 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRB3Q04118 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRB3Q04118 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRB3Q04118 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRB3Q04118 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRB3Q04118 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRB3Q04118 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRB3Q04118 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRB3Q04118 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRB3Q04118 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRB3Q04118 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRB3Q04118 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRB3Q04118 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRB3Q04118 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRB3Q04118 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PRB3Q04118 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms