Protein–RNA interactions for Protein: Q01151

CD83, CD83 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD83Q01151 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD83Q01151 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD83Q01151 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD83Q01151 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CD83Q01151 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CD83Q01151 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD83Q01151 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD83Q01151 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD83Q01151 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD83Q01151 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD83Q01151 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD83Q01151 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD83Q01151 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CD83Q01151 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD83Q01151 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD83Q01151 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD83Q01151 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD83Q01151 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD83Q01151 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD83Q01151 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD83Q01151 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD83Q01151 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD83Q01151 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD83Q01151 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD83Q01151 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD83Q01151 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CD83Q01151 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD83Q01151 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD83Q01151 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CD83Q01151 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD83Q01151 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD83Q01151 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD83Q01151 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD83Q01151 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD83Q01151 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD83Q01151 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD83Q01151 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD83Q01151 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD83Q01151 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD83Q01151 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CD83Q01151 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD83Q01151 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD83Q01151 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD83Q01151 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD83Q01151 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CD83Q01151 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD83Q01151 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD83Q01151 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD83Q01151 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD83Q01151 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD83Q01151 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD83Q01151 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD83Q01151 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD83Q01151 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD83Q01151 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD83Q01151 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD83Q01151 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD83Q01151 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CD83Q01151 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD83Q01151 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD83Q01151 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD83Q01151 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD83Q01151 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD83Q01151 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD83Q01151 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD83Q01151 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD83Q01151 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD83Q01151 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD83Q01151 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD83Q01151 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD83Q01151 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD83Q01151 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD83Q01151 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD83Q01151 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD83Q01151 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD83Q01151 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD83Q01151 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD83Q01151 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD83Q01151 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD83Q01151 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD83Q01151 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD83Q01151 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD83Q01151 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD83Q01151 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD83Q01151 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD83Q01151 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD83Q01151 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD83Q01151 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CD83Q01151 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD83Q01151 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD83Q01151 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CD83Q01151 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD83Q01151 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD83Q01151 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD83Q01151 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD83Q01151 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD83Q01151 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD83Q01151 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD83Q01151 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD83Q01151 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms