Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNA1BQ00975 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNA1BQ00975 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNA1BQ00975 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNA1BQ00975 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNA1BQ00975 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNA1BQ00975 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNA1BQ00975 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CACNA1BQ00975 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CACNA1BQ00975 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CACNA1BQ00975 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CACNA1BQ00975 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CACNA1BQ00975 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CACNA1BQ00975 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CACNA1BQ00975 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNA1BQ00975 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNA1BQ00975 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNA1BQ00975 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CACNA1BQ00975 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CACNA1BQ00975 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CACNA1BQ00975 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CACNA1BQ00975 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CACNA1BQ00975 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CACNA1BQ00975 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CACNA1BQ00975 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CACNA1BQ00975 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CACNA1BQ00975 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNA1BQ00975 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNA1BQ00975 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CACNA1BQ00975 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CACNA1BQ00975 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CACNA1BQ00975 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CACNA1BQ00975 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CACNA1BQ00975 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CACNA1BQ00975 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CACNA1BQ00975 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CACNA1BQ00975 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNA1BQ00975 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CACNA1BQ00975 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNA1BQ00975 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACNA1BQ00975 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CACNA1BQ00975 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CACNA1BQ00975 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CACNA1BQ00975 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CACNA1BQ00975 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CACNA1BQ00975 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNA1BQ00975 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNA1BQ00975 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CACNA1BQ00975 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CACNA1BQ00975 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNA1BQ00975 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNA1BQ00975 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNA1BQ00975 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNA1BQ00975 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CACNA1BQ00975 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNA1BQ00975 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNA1BQ00975 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CACNA1BQ00975 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CACNA1BQ00975 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CACNA1BQ00975 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNA1BQ00975 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNA1BQ00975 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNA1BQ00975 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNA1BQ00975 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNA1BQ00975 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNA1BQ00975 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CACNA1BQ00975 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
CACNA1BQ00975 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CACNA1BQ00975 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNA1BQ00975 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNA1BQ00975 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNA1BQ00975 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNA1BQ00975 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNA1BQ00975 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNA1BQ00975 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNA1BQ00975 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNA1BQ00975 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNA1BQ00975 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNA1BQ00975 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNA1BQ00975 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNA1BQ00975 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNA1BQ00975 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CACNA1BQ00975 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CACNA1BQ00975 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNA1BQ00975 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNA1BQ00975 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNA1BQ00975 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNA1BQ00975 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNA1BQ00975 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
CACNA1BQ00975 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNA1BQ00975 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNA1BQ00975 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNA1BQ00975 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNA1BQ00975 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CACNA1BQ00975 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNA1BQ00975 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNA1BQ00975 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNA1BQ00975 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNA1BQ00975 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CACNA1BQ00975 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms