Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SKOR1P84550 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SKOR1P84550 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SKOR1P84550 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SKOR1P84550 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SKOR1P84550 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SKOR1P84550 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SKOR1P84550 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SKOR1P84550 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SKOR1P84550 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SKOR1P84550 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SKOR1P84550 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SKOR1P84550 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SKOR1P84550 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SKOR1P84550 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SKOR1P84550 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SKOR1P84550 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SKOR1P84550 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SKOR1P84550 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SKOR1P84550 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SKOR1P84550 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SKOR1P84550 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SKOR1P84550 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SKOR1P84550 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SKOR1P84550 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SKOR1P84550 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SKOR1P84550 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SKOR1P84550 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SKOR1P84550 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SKOR1P84550 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SKOR1P84550 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SKOR1P84550 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SKOR1P84550 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SKOR1P84550 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SKOR1P84550 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SKOR1P84550 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SKOR1P84550 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SKOR1P84550 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SKOR1P84550 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SKOR1P84550 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SKOR1P84550 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SKOR1P84550 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SKOR1P84550 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SKOR1P84550 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SKOR1P84550 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SKOR1P84550 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SKOR1P84550 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SKOR1P84550 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SKOR1P84550 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SKOR1P84550 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SKOR1P84550 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SKOR1P84550 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SKOR1P84550 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SKOR1P84550 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SKOR1P84550 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SKOR1P84550 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SKOR1P84550 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SKOR1P84550 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SKOR1P84550 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SKOR1P84550 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SKOR1P84550 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SKOR1P84550 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SKOR1P84550 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SKOR1P84550 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SKOR1P84550 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SKOR1P84550 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SKOR1P84550 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SKOR1P84550 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SKOR1P84550 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SKOR1P84550 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SKOR1P84550 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SKOR1P84550 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SKOR1P84550 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SKOR1P84550 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SKOR1P84550 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SKOR1P84550 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SKOR1P84550 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SKOR1P84550 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SKOR1P84550 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SKOR1P84550 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SKOR1P84550 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SKOR1P84550 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SKOR1P84550 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SKOR1P84550 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SKOR1P84550 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SKOR1P84550 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SKOR1P84550 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SKOR1P84550 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SKOR1P84550 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SKOR1P84550 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SKOR1P84550 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SKOR1P84550 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SKOR1P84550 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SKOR1P84550 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SKOR1P84550 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SKOR1P84550 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SKOR1P84550 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SKOR1P84550 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SKOR1P84550 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SKOR1P84550 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms