Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CBX1P83916 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CBX1P83916 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CBX1P83916 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CBX1P83916 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CBX1P83916 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CBX1P83916 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CBX1P83916 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CBX1P83916 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CBX1P83916 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CBX1P83916 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CBX1P83916 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CBX1P83916 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CBX1P83916 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CBX1P83916 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CBX1P83916 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CBX1P83916 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CBX1P83916 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CBX1P83916 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CBX1P83916 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CBX1P83916 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CBX1P83916 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CBX1P83916 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CBX1P83916 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CBX1P83916 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CBX1P83916 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CBX1P83916 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CBX1P83916 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CBX1P83916 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CBX1P83916 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CBX1P83916 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CBX1P83916 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CBX1P83916 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CBX1P83916 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CBX1P83916 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CBX1P83916 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CBX1P83916 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CBX1P83916 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CBX1P83916 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CBX1P83916 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CBX1P83916 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CBX1P83916 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CBX1P83916 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CBX1P83916 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CBX1P83916 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CBX1P83916 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CBX1P83916 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CBX1P83916 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CBX1P83916 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CBX1P83916 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CBX1P83916 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CBX1P83916 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CBX1P83916 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CBX1P83916 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CBX1P83916 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CBX1P83916 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CBX1P83916 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CBX1P83916 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CBX1P83916 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CBX1P83916 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CBX1P83916 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CBX1P83916 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CBX1P83916 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CBX1P83916 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CBX1P83916 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CBX1P83916 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CBX1P83916 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CBX1P83916 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CBX1P83916 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CBX1P83916 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CBX1P83916 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CBX1P83916 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CBX1P83916 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CBX1P83916 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CBX1P83916 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CBX1P83916 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CBX1P83916 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CBX1P83916 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CBX1P83916 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CBX1P83916 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CBX1P83916 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CBX1P83916 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CBX1P83916 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CBX1P83916 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CBX1P83916 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CBX1P83916 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CBX1P83916 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CBX1P83916 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CBX1P83916 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CBX1P83916 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CBX1P83916 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CBX1P83916 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CBX1P83916 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CBX1P83916 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CBX1P83916 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CBX1P83916 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CBX1P83916 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CBX1P83916 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CBX1P83916 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CBX1P83916 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms