Protein–RNA interactions for Protein: P78559

MAP1A, Microtubule-associated protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1AP78559 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MAP1AP78559 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MAP1AP78559 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MAP1AP78559 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MAP1AP78559 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MAP1AP78559 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MAP1AP78559 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MAP1AP78559 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MAP1AP78559 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MAP1AP78559 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MAP1AP78559 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MAP1AP78559 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MAP1AP78559 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MAP1AP78559 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MAP1AP78559 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MAP1AP78559 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MAP1AP78559 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MAP1AP78559 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MAP1AP78559 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MAP1AP78559 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MAP1AP78559 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MAP1AP78559 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MAP1AP78559 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MAP1AP78559 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MAP1AP78559 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MAP1AP78559 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MAP1AP78559 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MAP1AP78559 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MAP1AP78559 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAP1AP78559 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP1AP78559 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP1AP78559 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MAP1AP78559 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MAP1AP78559 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAP1AP78559 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MAP1AP78559 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAP1AP78559 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAP1AP78559 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MAP1AP78559 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MAP1AP78559 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAP1AP78559 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAP1AP78559 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAP1AP78559 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAP1AP78559 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAP1AP78559 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAP1AP78559 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP1AP78559 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAP1AP78559 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MAP1AP78559 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MAP1AP78559 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MAP1AP78559 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAP1AP78559 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAP1AP78559 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAP1AP78559 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MAP1AP78559 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAP1AP78559 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAP1AP78559 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAP1AP78559 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAP1AP78559 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAP1AP78559 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAP1AP78559 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAP1AP78559 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAP1AP78559 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAP1AP78559 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAP1AP78559 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAP1AP78559 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAP1AP78559 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAP1AP78559 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAP1AP78559 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAP1AP78559 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAP1AP78559 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAP1AP78559 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAP1AP78559 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAP1AP78559 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAP1AP78559 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAP1AP78559 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAP1AP78559 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP1AP78559 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP1AP78559 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP1AP78559 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP1AP78559 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP1AP78559 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP1AP78559 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MAP1AP78559 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAP1AP78559 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAP1AP78559 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAP1AP78559 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAP1AP78559 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAP1AP78559 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAP1AP78559 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAP1AP78559 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAP1AP78559 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAP1AP78559 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAP1AP78559 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MAP1AP78559 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAP1AP78559 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAP1AP78559 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MAP1AP78559 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAP1AP78559 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAP1AP78559 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms