Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FAM193AP78312 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FAM193AP78312 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FAM193AP78312 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
FAM193AP78312 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FAM193AP78312 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FAM193AP78312 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FAM193AP78312 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
FAM193AP78312 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FAM193AP78312 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FAM193AP78312 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FAM193AP78312 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FAM193AP78312 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
FAM193AP78312 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
FAM193AP78312 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FAM193AP78312 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
FAM193AP78312 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
FAM193AP78312 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
FAM193AP78312 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FAM193AP78312 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FAM193AP78312 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
FAM193AP78312 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FAM193AP78312 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FAM193AP78312 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FAM193AP78312 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
FAM193AP78312 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FAM193AP78312 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FAM193AP78312 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FAM193AP78312 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FAM193AP78312 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FAM193AP78312 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FAM193AP78312 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FAM193AP78312 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FAM193AP78312 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FAM193AP78312 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FAM193AP78312 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FAM193AP78312 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FAM193AP78312 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FAM193AP78312 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FAM193AP78312 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FAM193AP78312 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FAM193AP78312 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
FAM193AP78312 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FAM193AP78312 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FAM193AP78312 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FAM193AP78312 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FAM193AP78312 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FAM193AP78312 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FAM193AP78312 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FAM193AP78312 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FAM193AP78312 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FAM193AP78312 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FAM193AP78312 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FAM193AP78312 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
FAM193AP78312 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FAM193AP78312 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FAM193AP78312 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FAM193AP78312 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FAM193AP78312 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FAM193AP78312 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FAM193AP78312 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FAM193AP78312 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FAM193AP78312 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FAM193AP78312 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FAM193AP78312 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
FAM193AP78312 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FAM193AP78312 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FAM193AP78312 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FAM193AP78312 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FAM193AP78312 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FAM193AP78312 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FAM193AP78312 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FAM193AP78312 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FAM193AP78312 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FAM193AP78312 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
FAM193AP78312 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FAM193AP78312 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FAM193AP78312 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FAM193AP78312 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FAM193AP78312 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FAM193AP78312 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FAM193AP78312 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FAM193AP78312 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FAM193AP78312 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FAM193AP78312 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FAM193AP78312 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
FAM193AP78312 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FAM193AP78312 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FAM193AP78312 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FAM193AP78312 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FAM193AP78312 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FAM193AP78312 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FAM193AP78312 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FAM193AP78312 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FAM193AP78312 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FAM193AP78312 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FAM193AP78312 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FAM193AP78312 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
FAM193AP78312 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
FAM193AP78312 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms