Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HBBP68871 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HBBP68871 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HBBP68871 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HBBP68871 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HBBP68871 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HBBP68871 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HBBP68871 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HBBP68871 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HBBP68871 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HBBP68871 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HBBP68871 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HBBP68871 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HBBP68871 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HBBP68871 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HBBP68871 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HBBP68871 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HBBP68871 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HBBP68871 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HBBP68871 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HBBP68871 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HBBP68871 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HBBP68871 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HBBP68871 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HBBP68871 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HBBP68871 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HBBP68871 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HBBP68871 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HBBP68871 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HBBP68871 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HBBP68871 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HBBP68871 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HBBP68871 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HBBP68871 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HBBP68871 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HBBP68871 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HBBP68871 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HBBP68871 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HBBP68871 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HBBP68871 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HBBP68871 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HBBP68871 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HBBP68871 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HBBP68871 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HBBP68871 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HBBP68871 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HBBP68871 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HBBP68871 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HBBP68871 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HBBP68871 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HBBP68871 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HBBP68871 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HBBP68871 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HBBP68871 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HBBP68871 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HBBP68871 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HBBP68871 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HBBP68871 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HBBP68871 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HBBP68871 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HBBP68871 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HBBP68871 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HBBP68871 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HBBP68871 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HBBP68871 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HBBP68871 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HBBP68871 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HBBP68871 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HBBP68871 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HBBP68871 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HBBP68871 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HBBP68871 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HBBP68871 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HBBP68871 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HBBP68871 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HBBP68871 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HBBP68871 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HBBP68871 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HBBP68871 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HBBP68871 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HBBP68871 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HBBP68871 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HBBP68871 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HBBP68871 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HBBP68871 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HBBP68871 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HBBP68871 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HBBP68871 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HBBP68871 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HBBP68871 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HBBP68871 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HBBP68871 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HBBP68871 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HBBP68871 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HBBP68871 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HBBP68871 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HBBP68871 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HBBP68871 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HBBP68871 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HBBP68871 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms