Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSNK2BP67870 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSNK2BP67870 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSNK2BP67870 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSNK2BP67870 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSNK2BP67870 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSNK2BP67870 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CSNK2BP67870 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSNK2BP67870 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSNK2BP67870 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSNK2BP67870 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSNK2BP67870 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSNK2BP67870 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSNK2BP67870 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSNK2BP67870 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSNK2BP67870 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSNK2BP67870 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSNK2BP67870 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSNK2BP67870 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSNK2BP67870 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSNK2BP67870 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSNK2BP67870 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSNK2BP67870 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSNK2BP67870 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSNK2BP67870 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSNK2BP67870 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSNK2BP67870 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSNK2BP67870 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSNK2BP67870 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSNK2BP67870 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CSNK2BP67870 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSNK2BP67870 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSNK2BP67870 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSNK2BP67870 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSNK2BP67870 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSNK2BP67870 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSNK2BP67870 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSNK2BP67870 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CSNK2BP67870 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSNK2BP67870 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSNK2BP67870 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSNK2BP67870 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSNK2BP67870 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSNK2BP67870 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSNK2BP67870 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CSNK2BP67870 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSNK2BP67870 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSNK2BP67870 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSNK2BP67870 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSNK2BP67870 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSNK2BP67870 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSNK2BP67870 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CSNK2BP67870 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CSNK2BP67870 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSNK2BP67870 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CSNK2BP67870 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSNK2BP67870 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSNK2BP67870 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSNK2BP67870 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSNK2BP67870 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSNK2BP67870 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSNK2BP67870 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSNK2BP67870 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSNK2BP67870 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSNK2BP67870 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSNK2BP67870 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSNK2BP67870 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSNK2BP67870 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSNK2BP67870 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSNK2BP67870 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSNK2BP67870 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CSNK2BP67870 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSNK2BP67870 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSNK2BP67870 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSNK2BP67870 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSNK2BP67870 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSNK2BP67870 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CSNK2BP67870 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSNK2BP67870 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSNK2BP67870 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSNK2BP67870 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSNK2BP67870 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSNK2BP67870 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSNK2BP67870 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSNK2BP67870 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSNK2BP67870 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSNK2BP67870 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSNK2BP67870 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSNK2BP67870 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSNK2BP67870 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSNK2BP67870 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSNK2BP67870 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSNK2BP67870 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSNK2BP67870 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSNK2BP67870 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSNK2BP67870 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSNK2BP67870 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSNK2BP67870 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSNK2BP67870 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSNK2BP67870 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.7 ms