Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHOBP62745 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHOBP62745 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOBP62745 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RHOBP62745 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOBP62745 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOBP62745 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOBP62745 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOBP62745 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOBP62745 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOBP62745 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOBP62745 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RHOBP62745 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOBP62745 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOBP62745 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOBP62745 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOBP62745 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOBP62745 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOBP62745 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHOBP62745 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHOBP62745 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHOBP62745 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHOBP62745 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOBP62745 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOBP62745 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHOBP62745 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOBP62745 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOBP62745 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOBP62745 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOBP62745 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOBP62745 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOBP62745 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOBP62745 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOBP62745 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOBP62745 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOBP62745 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOBP62745 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHOBP62745 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHOBP62745 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHOBP62745 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHOBP62745 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHOBP62745 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHOBP62745 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOBP62745 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOBP62745 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOBP62745 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOBP62745 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOBP62745 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOBP62745 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RHOBP62745 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOBP62745 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOBP62745 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOBP62745 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOBP62745 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOBP62745 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOBP62745 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOBP62745 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOBP62745 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOBP62745 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOBP62745 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOBP62745 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOBP62745 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOBP62745 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOBP62745 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOBP62745 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOBP62745 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOBP62745 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOBP62745 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOBP62745 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOBP62745 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOBP62745 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOBP62745 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOBP62745 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOBP62745 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOBP62745 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOBP62745 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOBP62745 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOBP62745 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOBP62745 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOBP62745 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOBP62745 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOBP62745 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOBP62745 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOBP62745 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOBP62745 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOBP62745 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOBP62745 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOBP62745 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOBP62745 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOBP62745 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOBP62745 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RHOBP62745 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOBP62745 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOBP62745 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOBP62745 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOBP62745 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOBP62745 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOBP62745 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOBP62745 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOBP62745 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms