Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHOBP62745 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHOBP62745 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOBP62745 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RHOBP62745 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOBP62745 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOBP62745 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOBP62745 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOBP62745 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOBP62745 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOBP62745 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOBP62745 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RHOBP62745 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOBP62745 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOBP62745 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOBP62745 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOBP62745 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOBP62745 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOBP62745 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHOBP62745 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHOBP62745 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHOBP62745 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHOBP62745 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOBP62745 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOBP62745 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHOBP62745 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOBP62745 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOBP62745 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOBP62745 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOBP62745 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOBP62745 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOBP62745 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOBP62745 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOBP62745 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOBP62745 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOBP62745 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOBP62745 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHOBP62745 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHOBP62745 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHOBP62745 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHOBP62745 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHOBP62745 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHOBP62745 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOBP62745 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOBP62745 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOBP62745 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOBP62745 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOBP62745 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOBP62745 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RHOBP62745 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOBP62745 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOBP62745 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOBP62745 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOBP62745 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOBP62745 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOBP62745 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOBP62745 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOBP62745 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOBP62745 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOBP62745 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOBP62745 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOBP62745 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOBP62745 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOBP62745 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOBP62745 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOBP62745 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOBP62745 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOBP62745 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOBP62745 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOBP62745 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOBP62745 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOBP62745 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOBP62745 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOBP62745 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOBP62745 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOBP62745 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOBP62745 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOBP62745 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOBP62745 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOBP62745 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOBP62745 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOBP62745 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOBP62745 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOBP62745 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOBP62745 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOBP62745 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOBP62745 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOBP62745 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOBP62745 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOBP62745 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOBP62745 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RHOBP62745 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOBP62745 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOBP62745 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOBP62745 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOBP62745 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOBP62745 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOBP62745 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOBP62745 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOBP62745 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms