Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CASP9P55211 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CASP9P55211 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CASP9P55211 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASP9P55211 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CASP9P55211 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CASP9P55211 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CASP9P55211 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASP9P55211 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASP9P55211 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASP9P55211 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASP9P55211 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASP9P55211 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASP9P55211 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASP9P55211 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASP9P55211 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASP9P55211 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASP9P55211 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASP9P55211 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASP9P55211 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASP9P55211 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASP9P55211 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASP9P55211 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASP9P55211 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASP9P55211 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CASP9P55211 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CASP9P55211 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CASP9P55211 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CASP9P55211 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CASP9P55211 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASP9P55211 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASP9P55211 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASP9P55211 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASP9P55211 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASP9P55211 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASP9P55211 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASP9P55211 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASP9P55211 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASP9P55211 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASP9P55211 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASP9P55211 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASP9P55211 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASP9P55211 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASP9P55211 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASP9P55211 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CASP9P55211 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASP9P55211 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASP9P55211 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CASP9P55211 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CASP9P55211 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CASP9P55211 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CASP9P55211 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP9P55211 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP9P55211 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP9P55211 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP9P55211 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP9P55211 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASP9P55211 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASP9P55211 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASP9P55211 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASP9P55211 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CASP9P55211 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASP9P55211 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASP9P55211 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASP9P55211 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASP9P55211 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASP9P55211 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASP9P55211 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASP9P55211 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CASP9P55211 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP9P55211 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP9P55211 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP9P55211 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASP9P55211 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASP9P55211 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASP9P55211 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASP9P55211 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP9P55211 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP9P55211 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP9P55211 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASP9P55211 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASP9P55211 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP9P55211 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP9P55211 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP9P55211 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP9P55211 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP9P55211 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASP9P55211 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASP9P55211 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASP9P55211 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CASP9P55211 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASP9P55211 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CASP9P55211 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASP9P55211 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASP9P55211 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASP9P55211 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASP9P55211 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASP9P55211 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASP9P55211 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASP9P55211 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms