Protein–RNA interactions for Protein: P54108

CRISP3, Cysteine-rich secretory protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP3P54108 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CRISP3P54108 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRISP3P54108 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRISP3P54108 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRISP3P54108 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CRISP3P54108 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRISP3P54108 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRISP3P54108 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRISP3P54108 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRISP3P54108 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRISP3P54108 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRISP3P54108 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRISP3P54108 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRISP3P54108 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRISP3P54108 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRISP3P54108 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRISP3P54108 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRISP3P54108 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRISP3P54108 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRISP3P54108 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRISP3P54108 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRISP3P54108 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRISP3P54108 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRISP3P54108 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRISP3P54108 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRISP3P54108 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRISP3P54108 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRISP3P54108 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRISP3P54108 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRISP3P54108 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRISP3P54108 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRISP3P54108 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRISP3P54108 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRISP3P54108 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRISP3P54108 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRISP3P54108 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRISP3P54108 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRISP3P54108 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRISP3P54108 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRISP3P54108 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRISP3P54108 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRISP3P54108 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRISP3P54108 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CRISP3P54108 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRISP3P54108 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRISP3P54108 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRISP3P54108 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRISP3P54108 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CRISP3P54108 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRISP3P54108 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CRISP3P54108 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRISP3P54108 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRISP3P54108 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRISP3P54108 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRISP3P54108 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRISP3P54108 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRISP3P54108 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRISP3P54108 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRISP3P54108 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRISP3P54108 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRISP3P54108 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRISP3P54108 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRISP3P54108 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRISP3P54108 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRISP3P54108 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRISP3P54108 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRISP3P54108 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRISP3P54108 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRISP3P54108 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRISP3P54108 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRISP3P54108 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRISP3P54108 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CRISP3P54108 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CRISP3P54108 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRISP3P54108 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRISP3P54108 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRISP3P54108 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRISP3P54108 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRISP3P54108 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRISP3P54108 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRISP3P54108 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRISP3P54108 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRISP3P54108 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRISP3P54108 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRISP3P54108 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRISP3P54108 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRISP3P54108 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRISP3P54108 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRISP3P54108 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CRISP3P54108 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRISP3P54108 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRISP3P54108 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRISP3P54108 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRISP3P54108 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRISP3P54108 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRISP3P54108 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRISP3P54108 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRISP3P54108 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRISP3P54108 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRISP3P54108 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms