Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GBX2P52951 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GBX2P52951 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GBX2P52951 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GBX2P52951 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GBX2P52951 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GBX2P52951 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GBX2P52951 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GBX2P52951 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GBX2P52951 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GBX2P52951 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GBX2P52951 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GBX2P52951 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GBX2P52951 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GBX2P52951 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GBX2P52951 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GBX2P52951 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GBX2P52951 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GBX2P52951 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GBX2P52951 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GBX2P52951 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GBX2P52951 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GBX2P52951 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GBX2P52951 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GBX2P52951 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GBX2P52951 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GBX2P52951 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GBX2P52951 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GBX2P52951 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GBX2P52951 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GBX2P52951 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GBX2P52951 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GBX2P52951 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GBX2P52951 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GBX2P52951 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GBX2P52951 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GBX2P52951 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBX2P52951 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBX2P52951 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GBX2P52951 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBX2P52951 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GBX2P52951 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBX2P52951 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBX2P52951 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBX2P52951 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBX2P52951 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBX2P52951 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GBX2P52951 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GBX2P52951 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GBX2P52951 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GBX2P52951 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GBX2P52951 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GBX2P52951 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GBX2P52951 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GBX2P52951 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBX2P52951 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBX2P52951 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBX2P52951 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBX2P52951 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GBX2P52951 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBX2P52951 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBX2P52951 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBX2P52951 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBX2P52951 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBX2P52951 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBX2P52951 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBX2P52951 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBX2P52951 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBX2P52951 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBX2P52951 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBX2P52951 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBX2P52951 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBX2P52951 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBX2P52951 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBX2P52951 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBX2P52951 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBX2P52951 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBX2P52951 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBX2P52951 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBX2P52951 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GBX2P52951 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBX2P52951 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBX2P52951 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBX2P52951 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBX2P52951 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBX2P52951 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GBX2P52951 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBX2P52951 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GBX2P52951 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GBX2P52951 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GBX2P52951 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GBX2P52951 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GBX2P52951 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GBX2P52951 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GBX2P52951 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GBX2P52951 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GBX2P52951 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GBX2P52951 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GBX2P52951 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GBX2P52951 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 982.9 ms