Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GSK3BP49841 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GSK3BP49841 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GSK3BP49841 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GSK3BP49841 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GSK3BP49841 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GSK3BP49841 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GSK3BP49841 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GSK3BP49841 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GSK3BP49841 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GSK3BP49841 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GSK3BP49841 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
GSK3BP49841 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GSK3BP49841 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GSK3BP49841 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GSK3BP49841 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GSK3BP49841 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GSK3BP49841 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GSK3BP49841 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GSK3BP49841 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GSK3BP49841 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GSK3BP49841 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GSK3BP49841 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GSK3BP49841 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GSK3BP49841 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GSK3BP49841 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GSK3BP49841 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
GSK3BP49841 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GSK3BP49841 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GSK3BP49841 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GSK3BP49841 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GSK3BP49841 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GSK3BP49841 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GSK3BP49841 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GSK3BP49841 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GSK3BP49841 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GSK3BP49841 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GSK3BP49841 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GSK3BP49841 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GSK3BP49841 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GSK3BP49841 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GSK3BP49841 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GSK3BP49841 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GSK3BP49841 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GSK3BP49841 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GSK3BP49841 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GSK3BP49841 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GSK3BP49841 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GSK3BP49841 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GSK3BP49841 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GSK3BP49841 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GSK3BP49841 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GSK3BP49841 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GSK3BP49841 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GSK3BP49841 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GSK3BP49841 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GSK3BP49841 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GSK3BP49841 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GSK3BP49841 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GSK3BP49841 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GSK3BP49841 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GSK3BP49841 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GSK3BP49841 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GSK3BP49841 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GSK3BP49841 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GSK3BP49841 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GSK3BP49841 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GSK3BP49841 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GSK3BP49841 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GSK3BP49841 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GSK3BP49841 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GSK3BP49841 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GSK3BP49841 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GSK3BP49841 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GSK3BP49841 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GSK3BP49841 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GSK3BP49841 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GSK3BP49841 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GSK3BP49841 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GSK3BP49841 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GSK3BP49841 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GSK3BP49841 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GSK3BP49841 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GSK3BP49841 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GSK3BP49841 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GSK3BP49841 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GSK3BP49841 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GSK3BP49841 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GSK3BP49841 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GSK3BP49841 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GSK3BP49841 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GSK3BP49841 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GSK3BP49841 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GSK3BP49841 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GSK3BP49841 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GSK3BP49841 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GSK3BP49841 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GSK3BP49841 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GSK3BP49841 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GSK3BP49841 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 229.2 ms