Protein–RNA interactions for Protein: P46781

RPS9, 40S ribosomal protein S9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS9P46781 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RPS9P46781 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
RPS9P46781 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RPS9P46781 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RPS9P46781 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RPS9P46781 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RPS9P46781 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RPS9P46781 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RPS9P46781 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RPS9P46781 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
RPS9P46781 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RPS9P46781 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RPS9P46781 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
RPS9P46781 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RPS9P46781 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RPS9P46781 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RPS9P46781 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RPS9P46781 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RPS9P46781 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RPS9P46781 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RPS9P46781 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RPS9P46781 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
RPS9P46781 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RPS9P46781 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RPS9P46781 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RPS9P46781 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RPS9P46781 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RPS9P46781 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RPS9P46781 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPS9P46781 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPS9P46781 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPS9P46781 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPS9P46781 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
RPS9P46781 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPS9P46781 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RPS9P46781 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RPS9P46781 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RPS9P46781 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPS9P46781 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPS9P46781 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPS9P46781 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RPS9P46781 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RPS9P46781 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RPS9P46781 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RPS9P46781 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
RPS9P46781 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPS9P46781 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPS9P46781 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPS9P46781 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPS9P46781 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPS9P46781 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPS9P46781 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RPS9P46781 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
RPS9P46781 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RPS9P46781 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RPS9P46781 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RPS9P46781 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPS9P46781 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RPS9P46781 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPS9P46781 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPS9P46781 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RPS9P46781 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RPS9P46781 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPS9P46781 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPS9P46781 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPS9P46781 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPS9P46781 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPS9P46781 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RPS9P46781 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RPS9P46781 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RPS9P46781 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RPS9P46781 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPS9P46781 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPS9P46781 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPS9P46781 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPS9P46781 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPS9P46781 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPS9P46781 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPS9P46781 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPS9P46781 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPS9P46781 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPS9P46781 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPS9P46781 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPS9P46781 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPS9P46781 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RPS9P46781 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RPS9P46781 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPS9P46781 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPS9P46781 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPS9P46781 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPS9P46781 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPS9P46781 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPS9P46781 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPS9P46781 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPS9P46781 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPS9P46781 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPS9P46781 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RPS9P46781 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
RPS9P46781 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RPS9P46781 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms