Protein–RNA interactions for Protein: P40969

CEP3, Centromere DNA-binding protein complex CBF3 subunit B, yeastyeast

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CEP3P40969 GAL1YBR020W 1587 nt11.73□□□□□ -0.53
CEP3P40969 PUS2YGL063W 1113 nt11.72□□□□□ -0.53
CEP3P40969 SNF1YDR477W 1902 nt11.72□□□□□ -0.53
CEP3P40969 FRD1YEL047C 1413 nt11.71□□□□□ -0.53
CEP3P40969 YPR011CYPR011C 981 nt11.71□□□□□ -0.53
CEP3P40969 BNA2YJR078W 1362 nt11.67□□□□□ -0.54
CEP3P40969 WSC2YNL283C 1512 nt11.67□□□□□ -0.54
CEP3P40969 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.67□□□□□ -0.54
CEP3P40969 DUS1YML080W 1272 nt11.66□□□□□ -0.54
CEP3P40969 DIC1YLR348C 897 nt11.64□□□□□ -0.55
CEP3P40969 AGP1YCL025C 1902 nt11.64□□□□□ -0.55
CEP3P40969 YGR259CYGR259C 441 nt11.63□□□□□ -0.55
CEP3P40969 YKR040CYKR040C 504 nt11.63□□□□□ -0.55
CEP3P40969 LPX1YOR084W 1164 nt11.62□□□□□ -0.55
CEP3P40969 ANP1YEL036C 1503 nt11.61□□□□□ -0.55
CEP3P40969 YCL074WYCL074W 927 nt11.61□□□□□ -0.55
CEP3P40969 ERV46YAL042W 1248 nt11.61□□□□□ -0.55
CEP3P40969 PBP1YGR178C 2169 nt11.61□□□□□ -0.55
CEP3P40969 CYT2YKL087C 675 nt11.59□□□□□ -0.55
CEP3P40969 MIC12YBR262C 321 nt11.58□□□□□ -0.56
CEP3P40969 IRC24YIR036C 792 nt11.56□□□□□ -0.56
CEP3P40969 HHO1YPL127C 777 nt11.53□□□□□ -0.56
CEP3P40969 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.51□□□□□ -0.57
CEP3P40969 STB1YNL309W 1263 nt11.5□□□□□ -0.57
CEP3P40969 FEN2YCR028C 1539 nt11.5□□□□□ -0.57
CEP3P40969 AQY1YPR192W 918 nt11.49□□□□□ -0.57
CEP3P40969 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.48□□□□□ -0.57
CEP3P40969 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.48□□□□□ -0.57
CEP3P40969 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.48□□□□□ -0.57
CEP3P40969 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.48□□□□□ -0.57
CEP3P40969 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.48□□□□□ -0.57
CEP3P40969 CMP2YML057W 1815 nt11.45□□□□□ -0.58
CEP3P40969 SPC25YER018C 666 nt11.45□□□□□ -0.58
CEP3P40969 RDN18-1RDN18-1 1800 nt11.43□□□□□ -0.58
CEP3P40969 RDN18-2RDN18-2 1800 nt11.43□□□□□ -0.58
CEP3P40969 YIR016WYIR016W 798 nt11.42□□□□□ -0.58
CEP3P40969 GPI16YHR188C 1833 nt11.4□□□□□ -0.58
CEP3P40969 STR3YGL184C 1398 nt11.4□□□□□ -0.59
CEP3P40969 XDJ1YLR090W 1380 nt11.4□□□□□ -0.59
CEP3P40969 DUT1YBR252W 444 nt11.38□□□□□ -0.59
CEP3P40969 VPS60YDR486C 690 nt11.37□□□□□ -0.59
CEP3P40969 PTH1YHR189W 573 nt11.36□□□□□ -0.59
CEP3P40969 YLR179CYLR179C 606 nt11.35□□□□□ -0.59
CEP3P40969 TIM23YNR017W 669 nt11.34□□□□□ -0.59
CEP3P40969 YAT1YAR035W 2064 nt11.34□□□□□ -0.59
CEP3P40969 YGR201CYGR201C 678 nt11.33□□□□□ -0.6
CEP3P40969 ALG3YBL082C 1377 nt11.31□□□□□ -0.6
CEP3P40969 AQY2YLL052C 450 nt11.31□□□□□ -0.6
CEP3P40969 CCT4YDL143W 1587 nt11.31□□□□□ -0.6
CEP3P40969 SWC5YBR231C 912 nt11.26□□□□□ -0.61
CEP3P40969 YLR235CYLR235C 399 nt11.25□□□□□ -0.61
CEP3P40969 AVT6YER119C 1347 nt11.23□□□□□ -0.61
CEP3P40969 NDI1YML120C 1542 nt11.22□□□□□ -0.61
CEP3P40969 GOR1YNL274C 1053 nt11.22□□□□□ -0.61
CEP3P40969 AHT1YHR093W 549 nt11.21□□□□□ -0.61
CEP3P40969 RTN2YDL204W 1182 nt11.2□□□□□ -0.62
CEP3P40969 GDH3YAL062W 1374 nt11.19□□□□□ -0.62
CEP3P40969 HSL7YBR133C 2484 nt11.17□□□□□ -0.62
CEP3P40969 SPP1YPL138C 1062 nt11.15□□□□□ -0.62
CEP3P40969 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.14□□□□□ -0.63
CEP3P40969 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.14□□□□□ -0.63
CEP3P40969 SPT20YOL148C 1815 nt11.09□□□□□ -0.63
CEP3P40969 YPR064WYPR064W 420 nt11.09□□□□□ -0.63
CEP3P40969 YKL030WYKL030W 606 nt11.06□□□□□ -0.64
CEP3P40969 HIF1YLL022C 1158 nt11.05□□□□□ -0.64
CEP3P40969 INA1YLR413W 2028 nt11.04□□□□□ -0.64
CEP3P40969 RPC82YPR190C 1965 nt11.03□□□□□ -0.64
CEP3P40969 PLB1YMR008C 1995 nt11.02□□□□□ -0.65
CEP3P40969 TAD3YLR316C 969 nt11.01□□□□□ -0.65
CEP3P40969 PRM5YIL117C 957 nt11□□□□□ -0.65
CEP3P40969 ALD4YOR374W 1560 nt10.99□□□□□ -0.65
CEP3P40969 SHM2YLR058C 1410 nt10.99□□□□□ -0.65
CEP3P40969 NBP35YGL091C 987 nt10.92□□□□□ -0.66
CEP3P40969 BDH1YAL060W 1149 nt10.92□□□□□ -0.66
CEP3P40969 ARP6YLR085C 1317 nt10.91□□□□□ -0.66
CEP3P40969 YLR415CYLR415C 339 nt10.89□□□□□ -0.67
CEP3P40969 DAT1YML113W 747 nt10.89□□□□□ -0.67
CEP3P40969 HEL2YDR266C 1920 nt10.89□□□□□ -0.67
CEP3P40969 RIM8YGL045W 1629 nt10.87□□□□□ -0.67
CEP3P40969 TIM17YJL143W 477 nt10.87□□□□□ -0.67
CEP3P40969 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.85□□□□□ -0.67
CEP3P40969 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.85□□□□□ -0.67
CEP3P40969 YCR102CYCR102C 1107 nt10.85□□□□□ -0.67
CEP3P40969 NIT1YIL164C 600 nt10.85□□□□□ -0.67
CEP3P40969 UTR1YJR049C 1593 nt10.82□□□□□ -0.68
CEP3P40969 MUP1YGR055W 1725 nt10.82□□□□□ -0.68
CEP3P40969 SGT2YOR007C 1041 nt10.79□□□□□ -0.68
CEP3P40969 ZRT3YKL175W 1512 nt10.79□□□□□ -0.68
CEP3P40969 YGL114WYGL114W 2178 nt10.73□□□□□ -0.69
CEP3P40969 YSP3YOR003W 1437 nt10.73□□□□□ -0.69
CEP3P40969 YJL067WYJL067W 351 nt10.71□□□□□ -0.69
CEP3P40969 GAP1YKR039W 1809 nt10.71□□□□□ -0.69
CEP3P40969 SAM35YHR083W 990 nt10.7□□□□□ -0.7
CEP3P40969 HOL1YNR055C 1761 nt10.7□□□□□ -0.7
CEP3P40969 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.68□□□□□ -0.7
CEP3P40969 NME1NME1 340 nt10.64□□□□□ -0.71
CEP3P40969 LSC2YGR244C 1284 nt10.63□□□□□ -0.71
CEP3P40969 YNL024CYNL024C 741 nt10.63□□□□□ -0.71
CEP3P40969 PRO1YDR300C 1287 nt10.62□□□□□ -0.71
CEP3P40969 TIR3YIL011W 810 nt10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 60 ms