Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TGFBR1P36897 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TGFBR1P36897 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TGFBR1P36897 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TGFBR1P36897 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TGFBR1P36897 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TGFBR1P36897 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TGFBR1P36897 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TGFBR1P36897 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TGFBR1P36897 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TGFBR1P36897 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TGFBR1P36897 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TGFBR1P36897 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TGFBR1P36897 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TGFBR1P36897 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TGFBR1P36897 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TGFBR1P36897 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TGFBR1P36897 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TGFBR1P36897 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TGFBR1P36897 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TGFBR1P36897 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TGFBR1P36897 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TGFBR1P36897 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TGFBR1P36897 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TGFBR1P36897 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TGFBR1P36897 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TGFBR1P36897 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TGFBR1P36897 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TGFBR1P36897 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TGFBR1P36897 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TGFBR1P36897 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TGFBR1P36897 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TGFBR1P36897 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TGFBR1P36897 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TGFBR1P36897 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TGFBR1P36897 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TGFBR1P36897 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TGFBR1P36897 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TGFBR1P36897 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TGFBR1P36897 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TGFBR1P36897 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TGFBR1P36897 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TGFBR1P36897 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TGFBR1P36897 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TGFBR1P36897 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TGFBR1P36897 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TGFBR1P36897 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TGFBR1P36897 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TGFBR1P36897 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TGFBR1P36897 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TGFBR1P36897 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TGFBR1P36897 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TGFBR1P36897 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TGFBR1P36897 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TGFBR1P36897 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TGFBR1P36897 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TGFBR1P36897 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TGFBR1P36897 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TGFBR1P36897 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TGFBR1P36897 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TGFBR1P36897 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TGFBR1P36897 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TGFBR1P36897 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TGFBR1P36897 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TGFBR1P36897 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TGFBR1P36897 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TGFBR1P36897 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TGFBR1P36897 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TGFBR1P36897 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TGFBR1P36897 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TGFBR1P36897 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TGFBR1P36897 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TGFBR1P36897 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TGFBR1P36897 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TGFBR1P36897 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TGFBR1P36897 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TGFBR1P36897 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TGFBR1P36897 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TGFBR1P36897 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TGFBR1P36897 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TGFBR1P36897 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TGFBR1P36897 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TGFBR1P36897 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TGFBR1P36897 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TGFBR1P36897 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TGFBR1P36897 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TGFBR1P36897 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TGFBR1P36897 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TGFBR1P36897 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TGFBR1P36897 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TGFBR1P36897 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TGFBR1P36897 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TGFBR1P36897 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TGFBR1P36897 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TGFBR1P36897 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TGFBR1P36897 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TGFBR1P36897 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TGFBR1P36897 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TGFBR1P36897 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TGFBR1P36897 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms