Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMB9P28065 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMB9P28065 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMB9P28065 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMB9P28065 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMB9P28065 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMB9P28065 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMB9P28065 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMB9P28065 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMB9P28065 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMB9P28065 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMB9P28065 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMB9P28065 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMB9P28065 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMB9P28065 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMB9P28065 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMB9P28065 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMB9P28065 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMB9P28065 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMB9P28065 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMB9P28065 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMB9P28065 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMB9P28065 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMB9P28065 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMB9P28065 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMB9P28065 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMB9P28065 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMB9P28065 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSMB9P28065 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSMB9P28065 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSMB9P28065 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSMB9P28065 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PSMB9P28065 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMB9P28065 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMB9P28065 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMB9P28065 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMB9P28065 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMB9P28065 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMB9P28065 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMB9P28065 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMB9P28065 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMB9P28065 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMB9P28065 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMB9P28065 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMB9P28065 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMB9P28065 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMB9P28065 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMB9P28065 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMB9P28065 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMB9P28065 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMB9P28065 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMB9P28065 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMB9P28065 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMB9P28065 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMB9P28065 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMB9P28065 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PSMB9P28065 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMB9P28065 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMB9P28065 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMB9P28065 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMB9P28065 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMB9P28065 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMB9P28065 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMB9P28065 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMB9P28065 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMB9P28065 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMB9P28065 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMB9P28065 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMB9P28065 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMB9P28065 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMB9P28065 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMB9P28065 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMB9P28065 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMB9P28065 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMB9P28065 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMB9P28065 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMB9P28065 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMB9P28065 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMB9P28065 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMB9P28065 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMB9P28065 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSMB9P28065 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMB9P28065 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMB9P28065 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMB9P28065 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMB9P28065 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMB9P28065 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMB9P28065 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMB9P28065 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMB9P28065 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMB9P28065 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMB9P28065 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMB9P28065 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMB9P28065 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMB9P28065 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMB9P28065 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMB9P28065 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMB9P28065 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMB9P28065 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMB9P28065 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms