Protein–RNA interactions for Protein: P26998

CRYBB3, Beta-crystallin B3, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBB3P26998 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRYBB3P26998 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRYBB3P26998 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRYBB3P26998 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRYBB3P26998 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRYBB3P26998 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRYBB3P26998 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRYBB3P26998 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRYBB3P26998 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRYBB3P26998 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRYBB3P26998 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRYBB3P26998 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRYBB3P26998 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRYBB3P26998 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRYBB3P26998 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRYBB3P26998 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRYBB3P26998 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRYBB3P26998 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRYBB3P26998 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRYBB3P26998 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRYBB3P26998 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRYBB3P26998 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRYBB3P26998 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRYBB3P26998 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRYBB3P26998 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRYBB3P26998 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRYBB3P26998 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRYBB3P26998 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRYBB3P26998 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRYBB3P26998 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRYBB3P26998 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRYBB3P26998 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRYBB3P26998 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRYBB3P26998 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRYBB3P26998 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRYBB3P26998 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRYBB3P26998 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRYBB3P26998 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRYBB3P26998 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRYBB3P26998 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRYBB3P26998 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRYBB3P26998 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRYBB3P26998 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRYBB3P26998 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRYBB3P26998 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRYBB3P26998 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRYBB3P26998 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRYBB3P26998 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRYBB3P26998 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRYBB3P26998 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRYBB3P26998 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRYBB3P26998 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRYBB3P26998 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRYBB3P26998 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CRYBB3P26998 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRYBB3P26998 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRYBB3P26998 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRYBB3P26998 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRYBB3P26998 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRYBB3P26998 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRYBB3P26998 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRYBB3P26998 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRYBB3P26998 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRYBB3P26998 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRYBB3P26998 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRYBB3P26998 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRYBB3P26998 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRYBB3P26998 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRYBB3P26998 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRYBB3P26998 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRYBB3P26998 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRYBB3P26998 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRYBB3P26998 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRYBB3P26998 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CRYBB3P26998 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CRYBB3P26998 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CRYBB3P26998 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CRYBB3P26998 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRYBB3P26998 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRYBB3P26998 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CRYBB3P26998 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRYBB3P26998 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CRYBB3P26998 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRYBB3P26998 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CRYBB3P26998 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRYBB3P26998 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRYBB3P26998 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CRYBB3P26998 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRYBB3P26998 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRYBB3P26998 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRYBB3P26998 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CRYBB3P26998 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRYBB3P26998 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRYBB3P26998 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRYBB3P26998 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRYBB3P26998 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRYBB3P26998 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CRYBB3P26998 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRYBB3P26998 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRYBB3P26998 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms