Protein–RNA interactions for Protein: P23759

PAX7, Paired box protein Pax-7, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX7P23759 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PAX7P23759 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PAX7P23759 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PAX7P23759 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PAX7P23759 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PAX7P23759 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PAX7P23759 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PAX7P23759 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PAX7P23759 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PAX7P23759 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PAX7P23759 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PAX7P23759 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PAX7P23759 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PAX7P23759 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PAX7P23759 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PAX7P23759 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PAX7P23759 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PAX7P23759 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAX7P23759 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PAX7P23759 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PAX7P23759 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PAX7P23759 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PAX7P23759 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PAX7P23759 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAX7P23759 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PAX7P23759 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PAX7P23759 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PAX7P23759 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PAX7P23759 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PAX7P23759 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PAX7P23759 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PAX7P23759 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PAX7P23759 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PAX7P23759 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PAX7P23759 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PAX7P23759 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PAX7P23759 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PAX7P23759 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PAX7P23759 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PAX7P23759 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PAX7P23759 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PAX7P23759 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PAX7P23759 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PAX7P23759 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PAX7P23759 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PAX7P23759 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PAX7P23759 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PAX7P23759 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PAX7P23759 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PAX7P23759 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PAX7P23759 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PAX7P23759 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PAX7P23759 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PAX7P23759 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAX7P23759 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAX7P23759 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAX7P23759 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAX7P23759 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PAX7P23759 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PAX7P23759 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PAX7P23759 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PAX7P23759 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PAX7P23759 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PAX7P23759 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PAX7P23759 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PAX7P23759 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PAX7P23759 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PAX7P23759 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PAX7P23759 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PAX7P23759 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PAX7P23759 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PAX7P23759 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PAX7P23759 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PAX7P23759 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PAX7P23759 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PAX7P23759 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PAX7P23759 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PAX7P23759 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PAX7P23759 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PAX7P23759 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PAX7P23759 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PAX7P23759 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PAX7P23759 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PAX7P23759 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PAX7P23759 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PAX7P23759 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PAX7P23759 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PAX7P23759 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PAX7P23759 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PAX7P23759 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PAX7P23759 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PAX7P23759 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PAX7P23759 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PAX7P23759 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PAX7P23759 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PAX7P23759 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PAX7P23759 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PAX7P23759 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PAX7P23759 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PAX7P23759 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms