Protein–RNA interactions for Protein: P23297

S100A1, Protein S100-A1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A1P23297 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
S100A1P23297 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
S100A1P23297 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
S100A1P23297 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
S100A1P23297 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
S100A1P23297 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
S100A1P23297 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
S100A1P23297 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
S100A1P23297 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
S100A1P23297 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
S100A1P23297 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
S100A1P23297 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
S100A1P23297 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
S100A1P23297 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
S100A1P23297 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
S100A1P23297 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
S100A1P23297 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
S100A1P23297 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
S100A1P23297 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
S100A1P23297 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
S100A1P23297 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
S100A1P23297 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
S100A1P23297 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
S100A1P23297 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
S100A1P23297 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
S100A1P23297 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
S100A1P23297 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
S100A1P23297 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
S100A1P23297 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
S100A1P23297 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
S100A1P23297 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
S100A1P23297 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
S100A1P23297 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
S100A1P23297 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
S100A1P23297 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
S100A1P23297 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
S100A1P23297 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
S100A1P23297 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
S100A1P23297 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
S100A1P23297 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
S100A1P23297 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
S100A1P23297 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
S100A1P23297 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
S100A1P23297 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
S100A1P23297 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
S100A1P23297 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
S100A1P23297 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
S100A1P23297 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
S100A1P23297 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
S100A1P23297 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
S100A1P23297 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
S100A1P23297 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
S100A1P23297 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
S100A1P23297 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
S100A1P23297 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
S100A1P23297 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
S100A1P23297 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
S100A1P23297 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
S100A1P23297 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
S100A1P23297 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
S100A1P23297 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
S100A1P23297 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
S100A1P23297 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
S100A1P23297 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
S100A1P23297 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
S100A1P23297 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
S100A1P23297 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
S100A1P23297 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
S100A1P23297 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
S100A1P23297 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
S100A1P23297 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
S100A1P23297 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
S100A1P23297 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
S100A1P23297 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
S100A1P23297 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
S100A1P23297 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
S100A1P23297 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
S100A1P23297 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
S100A1P23297 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
S100A1P23297 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
S100A1P23297 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
S100A1P23297 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
S100A1P23297 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
S100A1P23297 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
S100A1P23297 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
S100A1P23297 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
S100A1P23297 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
S100A1P23297 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
S100A1P23297 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
S100A1P23297 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
S100A1P23297 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
S100A1P23297 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
S100A1P23297 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
S100A1P23297 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
S100A1P23297 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
S100A1P23297 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
S100A1P23297 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
S100A1P23297 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
S100A1P23297 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
S100A1P23297 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms