Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C4BPBP20851 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4BPBP20851 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4BPBP20851 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C4BPBP20851 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C4BPBP20851 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C4BPBP20851 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4BPBP20851 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C4BPBP20851 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4BPBP20851 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4BPBP20851 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
C4BPBP20851 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4BPBP20851 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4BPBP20851 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4BPBP20851 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4BPBP20851 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4BPBP20851 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4BPBP20851 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4BPBP20851 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4BPBP20851 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C4BPBP20851 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C4BPBP20851 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C4BPBP20851 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C4BPBP20851 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4BPBP20851 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4BPBP20851 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4BPBP20851 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4BPBP20851 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4BPBP20851 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4BPBP20851 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C4BPBP20851 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4BPBP20851 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C4BPBP20851 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C4BPBP20851 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C4BPBP20851 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C4BPBP20851 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C4BPBP20851 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C4BPBP20851 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C4BPBP20851 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4BPBP20851 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4BPBP20851 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4BPBP20851 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4BPBP20851 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C4BPBP20851 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C4BPBP20851 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C4BPBP20851 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C4BPBP20851 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C4BPBP20851 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4BPBP20851 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4BPBP20851 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4BPBP20851 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4BPBP20851 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C4BPBP20851 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C4BPBP20851 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C4BPBP20851 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C4BPBP20851 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C4BPBP20851 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C4BPBP20851 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C4BPBP20851 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C4BPBP20851 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C4BPBP20851 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C4BPBP20851 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C4BPBP20851 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C4BPBP20851 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C4BPBP20851 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C4BPBP20851 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C4BPBP20851 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C4BPBP20851 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C4BPBP20851 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C4BPBP20851 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C4BPBP20851 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C4BPBP20851 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C4BPBP20851 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C4BPBP20851 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C4BPBP20851 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C4BPBP20851 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C4BPBP20851 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C4BPBP20851 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C4BPBP20851 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C4BPBP20851 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C4BPBP20851 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C4BPBP20851 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4BPBP20851 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4BPBP20851 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4BPBP20851 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4BPBP20851 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C4BPBP20851 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C4BPBP20851 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C4BPBP20851 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C4BPBP20851 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C4BPBP20851 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C4BPBP20851 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C4BPBP20851 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
C4BPBP20851 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C4BPBP20851 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C4BPBP20851 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C4BPBP20851 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C4BPBP20851 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C4BPBP20851 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C4BPBP20851 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms