Protein–RNA interactions for Protein: P20340

RAB6A, Ras-related protein Rab-6A, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6AP20340 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB6AP20340 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB6AP20340 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB6AP20340 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB6AP20340 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB6AP20340 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB6AP20340 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB6AP20340 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB6AP20340 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RAB6AP20340 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB6AP20340 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB6AP20340 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB6AP20340 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB6AP20340 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB6AP20340 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB6AP20340 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB6AP20340 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB6AP20340 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB6AP20340 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB6AP20340 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB6AP20340 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB6AP20340 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB6AP20340 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB6AP20340 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB6AP20340 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RAB6AP20340 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB6AP20340 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB6AP20340 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB6AP20340 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB6AP20340 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB6AP20340 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB6AP20340 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB6AP20340 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB6AP20340 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB6AP20340 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB6AP20340 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB6AP20340 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB6AP20340 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB6AP20340 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB6AP20340 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB6AP20340 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB6AP20340 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB6AP20340 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB6AP20340 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB6AP20340 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB6AP20340 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB6AP20340 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB6AP20340 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB6AP20340 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB6AP20340 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB6AP20340 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB6AP20340 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB6AP20340 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB6AP20340 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB6AP20340 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB6AP20340 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB6AP20340 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB6AP20340 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB6AP20340 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB6AP20340 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB6AP20340 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB6AP20340 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB6AP20340 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB6AP20340 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB6AP20340 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB6AP20340 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB6AP20340 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB6AP20340 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB6AP20340 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB6AP20340 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB6AP20340 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB6AP20340 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB6AP20340 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB6AP20340 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB6AP20340 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB6AP20340 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB6AP20340 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB6AP20340 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB6AP20340 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB6AP20340 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB6AP20340 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB6AP20340 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB6AP20340 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB6AP20340 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB6AP20340 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB6AP20340 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB6AP20340 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB6AP20340 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB6AP20340 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB6AP20340 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB6AP20340 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB6AP20340 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB6AP20340 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB6AP20340 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB6AP20340 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB6AP20340 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB6AP20340 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB6AP20340 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB6AP20340 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB6AP20340 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms