Protein–RNA interactions for Protein: P18848

ATF4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF4P18848 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF4P18848 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF4P18848 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATF4P18848 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATF4P18848 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF4P18848 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF4P18848 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF4P18848 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF4P18848 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF4P18848 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF4P18848 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF4P18848 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF4P18848 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF4P18848 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATF4P18848 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF4P18848 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF4P18848 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF4P18848 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF4P18848 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF4P18848 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF4P18848 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF4P18848 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF4P18848 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF4P18848 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF4P18848 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF4P18848 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF4P18848 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF4P18848 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF4P18848 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF4P18848 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF4P18848 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF4P18848 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF4P18848 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF4P18848 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF4P18848 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF4P18848 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF4P18848 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF4P18848 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF4P18848 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF4P18848 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF4P18848 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF4P18848 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF4P18848 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATF4P18848 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATF4P18848 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF4P18848 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF4P18848 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF4P18848 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF4P18848 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF4P18848 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF4P18848 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF4P18848 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF4P18848 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF4P18848 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATF4P18848 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATF4P18848 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATF4P18848 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF4P18848 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF4P18848 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF4P18848 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF4P18848 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF4P18848 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF4P18848 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF4P18848 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF4P18848 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF4P18848 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATF4P18848 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATF4P18848 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATF4P18848 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATF4P18848 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATF4P18848 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATF4P18848 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF4P18848 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATF4P18848 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATF4P18848 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATF4P18848 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATF4P18848 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF4P18848 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF4P18848 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF4P18848 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF4P18848 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF4P18848 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF4P18848 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF4P18848 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF4P18848 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF4P18848 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF4P18848 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF4P18848 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF4P18848 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF4P18848 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF4P18848 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF4P18848 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF4P18848 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF4P18848 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF4P18848 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF4P18848 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF4P18848 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF4P18848 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF4P18848 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF4P18848 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms