Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NELFEP18615 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NELFEP18615 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NELFEP18615 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NELFEP18615 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NELFEP18615 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NELFEP18615 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NELFEP18615 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NELFEP18615 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NELFEP18615 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NELFEP18615 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NELFEP18615 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NELFEP18615 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NELFEP18615 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NELFEP18615 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NELFEP18615 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NELFEP18615 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NELFEP18615 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NELFEP18615 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NELFEP18615 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NELFEP18615 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NELFEP18615 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NELFEP18615 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NELFEP18615 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NELFEP18615 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NELFEP18615 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NELFEP18615 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NELFEP18615 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NELFEP18615 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NELFEP18615 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NELFEP18615 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NELFEP18615 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NELFEP18615 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NELFEP18615 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NELFEP18615 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NELFEP18615 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NELFEP18615 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NELFEP18615 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NELFEP18615 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NELFEP18615 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NELFEP18615 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NELFEP18615 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NELFEP18615 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NELFEP18615 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NELFEP18615 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NELFEP18615 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NELFEP18615 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NELFEP18615 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NELFEP18615 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NELFEP18615 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NELFEP18615 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NELFEP18615 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NELFEP18615 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NELFEP18615 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NELFEP18615 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NELFEP18615 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NELFEP18615 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NELFEP18615 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NELFEP18615 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NELFEP18615 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NELFEP18615 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NELFEP18615 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NELFEP18615 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NELFEP18615 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NELFEP18615 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NELFEP18615 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NELFEP18615 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NELFEP18615 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NELFEP18615 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NELFEP18615 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NELFEP18615 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NELFEP18615 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NELFEP18615 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NELFEP18615 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NELFEP18615 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NELFEP18615 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NELFEP18615 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NELFEP18615 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NELFEP18615 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NELFEP18615 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NELFEP18615 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NELFEP18615 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NELFEP18615 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NELFEP18615 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NELFEP18615 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NELFEP18615 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NELFEP18615 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NELFEP18615 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NELFEP18615 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NELFEP18615 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NELFEP18615 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NELFEP18615 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NELFEP18615 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NELFEP18615 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NELFEP18615 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NELFEP18615 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NELFEP18615 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NELFEP18615 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NELFEP18615 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NELFEP18615 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms