Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRPBP14678 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRPBP14678 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPBP14678 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPBP14678 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRPBP14678 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRPBP14678 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRPBP14678 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SNRPBP14678 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRPBP14678 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRPBP14678 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNRPBP14678 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNRPBP14678 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRPBP14678 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRPBP14678 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRPBP14678 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRPBP14678 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRPBP14678 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRPBP14678 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRPBP14678 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRPBP14678 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNRPBP14678 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNRPBP14678 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNRPBP14678 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNRPBP14678 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNRPBP14678 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRPBP14678 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRPBP14678 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRPBP14678 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRPBP14678 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRPBP14678 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRPBP14678 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRPBP14678 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRPBP14678 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRPBP14678 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNRPBP14678 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNRPBP14678 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNRPBP14678 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNRPBP14678 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNRPBP14678 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNRPBP14678 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNRPBP14678 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNRPBP14678 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRPBP14678 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRPBP14678 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRPBP14678 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRPBP14678 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRPBP14678 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNRPBP14678 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNRPBP14678 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRPBP14678 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRPBP14678 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRPBP14678 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRPBP14678 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRPBP14678 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SNRPBP14678 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNRPBP14678 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNRPBP14678 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SNRPBP14678 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNRPBP14678 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNRPBP14678 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNRPBP14678 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRPBP14678 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRPBP14678 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNRPBP14678 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNRPBP14678 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRPBP14678 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRPBP14678 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRPBP14678 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRPBP14678 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNRPBP14678 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNRPBP14678 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SNRPBP14678 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNRPBP14678 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNRPBP14678 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNRPBP14678 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNRPBP14678 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNRPBP14678 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNRPBP14678 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNRPBP14678 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNRPBP14678 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNRPBP14678 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNRPBP14678 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNRPBP14678 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNRPBP14678 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNRPBP14678 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNRPBP14678 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNRPBP14678 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNRPBP14678 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNRPBP14678 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SNRPBP14678 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNRPBP14678 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNRPBP14678 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNRPBP14678 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNRPBP14678 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNRPBP14678 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRPBP14678 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRPBP14678 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRPBP14678 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRPBP14678 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms