Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C8orf88P0DMB2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C8orf88P0DMB2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C8orf88P0DMB2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C8orf88P0DMB2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C8orf88P0DMB2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C8orf88P0DMB2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C8orf88P0DMB2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C8orf88P0DMB2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C8orf88P0DMB2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C8orf88P0DMB2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
C8orf88P0DMB2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
C8orf88P0DMB2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf88P0DMB2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf88P0DMB2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf88P0DMB2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf88P0DMB2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C8orf88P0DMB2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C8orf88P0DMB2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C8orf88P0DMB2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C8orf88P0DMB2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
C8orf88P0DMB2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C8orf88P0DMB2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C8orf88P0DMB2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C8orf88P0DMB2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C8orf88P0DMB2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C8orf88P0DMB2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C8orf88P0DMB2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C8orf88P0DMB2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C8orf88P0DMB2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C8orf88P0DMB2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C8orf88P0DMB2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C8orf88P0DMB2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C8orf88P0DMB2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C8orf88P0DMB2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C8orf88P0DMB2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C8orf88P0DMB2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
C8orf88P0DMB2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C8orf88P0DMB2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C8orf88P0DMB2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C8orf88P0DMB2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C8orf88P0DMB2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8orf88P0DMB2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8orf88P0DMB2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C8orf88P0DMB2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C8orf88P0DMB2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C8orf88P0DMB2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C8orf88P0DMB2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf88P0DMB2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf88P0DMB2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf88P0DMB2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C8orf88P0DMB2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C8orf88P0DMB2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C8orf88P0DMB2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C8orf88P0DMB2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf88P0DMB2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf88P0DMB2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
C8orf88P0DMB2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C8orf88P0DMB2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C8orf88P0DMB2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C8orf88P0DMB2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C8orf88P0DMB2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C8orf88P0DMB2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C8orf88P0DMB2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C8orf88P0DMB2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C8orf88P0DMB2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C8orf88P0DMB2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C8orf88P0DMB2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C8orf88P0DMB2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C8orf88P0DMB2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C8orf88P0DMB2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C8orf88P0DMB2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf88P0DMB2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf88P0DMB2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf88P0DMB2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf88P0DMB2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C8orf88P0DMB2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C8orf88P0DMB2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf88P0DMB2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf88P0DMB2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf88P0DMB2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf88P0DMB2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf88P0DMB2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf88P0DMB2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf88P0DMB2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf88P0DMB2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C8orf88P0DMB2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C8orf88P0DMB2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
C8orf88P0DMB2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C8orf88P0DMB2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C8orf88P0DMB2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C8orf88P0DMB2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C8orf88P0DMB2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C8orf88P0DMB2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C8orf88P0DMB2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C8orf88P0DMB2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C8orf88P0DMB2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C8orf88P0DMB2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C8orf88P0DMB2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C8orf88P0DMB2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms