Protein–RNA interactions for Protein: P0CF51

TRGC1, T-cell receptor gamma chain C region 1, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRGC1P0CF51 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRGC1P0CF51 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRGC1P0CF51 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRGC1P0CF51 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRGC1P0CF51 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRGC1P0CF51 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRGC1P0CF51 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRGC1P0CF51 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRGC1P0CF51 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRGC1P0CF51 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRGC1P0CF51 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRGC1P0CF51 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRGC1P0CF51 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRGC1P0CF51 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRGC1P0CF51 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRGC1P0CF51 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRGC1P0CF51 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRGC1P0CF51 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRGC1P0CF51 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRGC1P0CF51 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRGC1P0CF51 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRGC1P0CF51 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRGC1P0CF51 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRGC1P0CF51 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRGC1P0CF51 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRGC1P0CF51 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRGC1P0CF51 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRGC1P0CF51 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRGC1P0CF51 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRGC1P0CF51 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRGC1P0CF51 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRGC1P0CF51 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRGC1P0CF51 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRGC1P0CF51 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRGC1P0CF51 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRGC1P0CF51 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRGC1P0CF51 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRGC1P0CF51 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRGC1P0CF51 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRGC1P0CF51 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRGC1P0CF51 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRGC1P0CF51 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRGC1P0CF51 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRGC1P0CF51 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRGC1P0CF51 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRGC1P0CF51 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRGC1P0CF51 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRGC1P0CF51 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRGC1P0CF51 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRGC1P0CF51 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRGC1P0CF51 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRGC1P0CF51 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRGC1P0CF51 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRGC1P0CF51 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRGC1P0CF51 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRGC1P0CF51 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRGC1P0CF51 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRGC1P0CF51 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRGC1P0CF51 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRGC1P0CF51 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRGC1P0CF51 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRGC1P0CF51 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRGC1P0CF51 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRGC1P0CF51 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRGC1P0CF51 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRGC1P0CF51 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRGC1P0CF51 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRGC1P0CF51 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRGC1P0CF51 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRGC1P0CF51 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRGC1P0CF51 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRGC1P0CF51 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRGC1P0CF51 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRGC1P0CF51 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRGC1P0CF51 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRGC1P0CF51 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRGC1P0CF51 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRGC1P0CF51 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRGC1P0CF51 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRGC1P0CF51 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRGC1P0CF51 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRGC1P0CF51 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRGC1P0CF51 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRGC1P0CF51 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRGC1P0CF51 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRGC1P0CF51 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRGC1P0CF51 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRGC1P0CF51 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRGC1P0CF51 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRGC1P0CF51 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRGC1P0CF51 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRGC1P0CF51 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRGC1P0CF51 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRGC1P0CF51 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRGC1P0CF51 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRGC1P0CF51 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRGC1P0CF51 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRGC1P0CF51 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRGC1P0CF51 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRGC1P0CF51 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms