Protein–RNA interactions for Protein: P09936

UCHL1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L1, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UCHL1P09936 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UCHL1P09936 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UCHL1P09936 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UCHL1P09936 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
UCHL1P09936 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UCHL1P09936 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UCHL1P09936 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UCHL1P09936 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UCHL1P09936 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UCHL1P09936 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UCHL1P09936 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UCHL1P09936 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UCHL1P09936 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UCHL1P09936 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UCHL1P09936 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UCHL1P09936 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
UCHL1P09936 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UCHL1P09936 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UCHL1P09936 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UCHL1P09936 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UCHL1P09936 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UCHL1P09936 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UCHL1P09936 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UCHL1P09936 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UCHL1P09936 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UCHL1P09936 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UCHL1P09936 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UCHL1P09936 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UCHL1P09936 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UCHL1P09936 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
UCHL1P09936 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UCHL1P09936 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
UCHL1P09936 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UCHL1P09936 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UCHL1P09936 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UCHL1P09936 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UCHL1P09936 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UCHL1P09936 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UCHL1P09936 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UCHL1P09936 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UCHL1P09936 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UCHL1P09936 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UCHL1P09936 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UCHL1P09936 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UCHL1P09936 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UCHL1P09936 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UCHL1P09936 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UCHL1P09936 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UCHL1P09936 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UCHL1P09936 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UCHL1P09936 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UCHL1P09936 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UCHL1P09936 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UCHL1P09936 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UCHL1P09936 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UCHL1P09936 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UCHL1P09936 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UCHL1P09936 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UCHL1P09936 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UCHL1P09936 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UCHL1P09936 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
UCHL1P09936 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UCHL1P09936 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UCHL1P09936 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UCHL1P09936 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UCHL1P09936 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UCHL1P09936 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UCHL1P09936 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UCHL1P09936 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UCHL1P09936 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UCHL1P09936 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
UCHL1P09936 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UCHL1P09936 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UCHL1P09936 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UCHL1P09936 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UCHL1P09936 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UCHL1P09936 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UCHL1P09936 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UCHL1P09936 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UCHL1P09936 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UCHL1P09936 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UCHL1P09936 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UCHL1P09936 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UCHL1P09936 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UCHL1P09936 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UCHL1P09936 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UCHL1P09936 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UCHL1P09936 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UCHL1P09936 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UCHL1P09936 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UCHL1P09936 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UCHL1P09936 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UCHL1P09936 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
UCHL1P09936 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UCHL1P09936 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UCHL1P09936 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UCHL1P09936 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UCHL1P09936 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UCHL1P09936 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UCHL1P09936 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms