Protein–RNA interactions for Protein: P09430

TNP1, Spermatid nuclear transition protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP1P09430 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP1P09430 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP1P09430 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TNP1P09430 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TNP1P09430 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TNP1P09430 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
TNP1P09430 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TNP1P09430 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TNP1P09430 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP1P09430 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP1P09430 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP1P09430 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP1P09430 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP1P09430 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP1P09430 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP1P09430 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP1P09430 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP1P09430 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TNP1P09430 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TNP1P09430 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TNP1P09430 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TNP1P09430 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNP1P09430 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TNP1P09430 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP1P09430 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP1P09430 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP1P09430 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP1P09430 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP1P09430 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP1P09430 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP1P09430 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP1P09430 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP1P09430 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP1P09430 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP1P09430 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP1P09430 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP1P09430 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP1P09430 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP1P09430 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNP1P09430 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNP1P09430 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNP1P09430 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNP1P09430 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TNP1P09430 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNP1P09430 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNP1P09430 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNP1P09430 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP1P09430 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP1P09430 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP1P09430 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP1P09430 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP1P09430 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP1P09430 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP1P09430 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP1P09430 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP1P09430 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP1P09430 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP1P09430 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP1P09430 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP1P09430 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP1P09430 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP1P09430 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP1P09430 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP1P09430 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNP1P09430 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNP1P09430 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNP1P09430 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNP1P09430 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNP1P09430 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNP1P09430 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNP1P09430 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP1P09430 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP1P09430 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP1P09430 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNP1P09430 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNP1P09430 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNP1P09430 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNP1P09430 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP1P09430 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP1P09430 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP1P09430 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP1P09430 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP1P09430 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP1P09430 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP1P09430 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP1P09430 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP1P09430 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP1P09430 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TNP1P09430 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNP1P09430 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNP1P09430 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNP1P09430 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNP1P09430 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNP1P09430 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNP1P09430 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP1P09430 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP1P09430 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP1P09430 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP1P09430 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP1P09430 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms