Protein–RNA interactions for Protein: P08865

RPSA, 40S ribosomal protein SA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP08865 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPSAP08865 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPSAP08865 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPSAP08865 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPSAP08865 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPSAP08865 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPSAP08865 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPSAP08865 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPSAP08865 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPSAP08865 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPSAP08865 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPSAP08865 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPSAP08865 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPSAP08865 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPSAP08865 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPSAP08865 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPSAP08865 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPSAP08865 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPSAP08865 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RPSAP08865 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RPSAP08865 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPSAP08865 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPSAP08865 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPSAP08865 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPSAP08865 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPSAP08865 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RPSAP08865 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPSAP08865 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPSAP08865 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPSAP08865 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPSAP08865 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPSAP08865 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPSAP08865 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPSAP08865 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RPSAP08865 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPSAP08865 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPSAP08865 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPSAP08865 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPSAP08865 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPSAP08865 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPSAP08865 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPSAP08865 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPSAP08865 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
RPSAP08865 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPSAP08865 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPSAP08865 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPSAP08865 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPSAP08865 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPSAP08865 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPSAP08865 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RPSAP08865 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPSAP08865 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPSAP08865 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPSAP08865 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPSAP08865 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPSAP08865 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPSAP08865 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPSAP08865 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPSAP08865 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPSAP08865 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPSAP08865 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPSAP08865 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPSAP08865 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPSAP08865 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPSAP08865 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPSAP08865 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPSAP08865 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RPSAP08865 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RPSAP08865 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RPSAP08865 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPSAP08865 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPSAP08865 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPSAP08865 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPSAP08865 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPSAP08865 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPSAP08865 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPSAP08865 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPSAP08865 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPSAP08865 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RPSAP08865 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RPSAP08865 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPSAP08865 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPSAP08865 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPSAP08865 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPSAP08865 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPSAP08865 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPSAP08865 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RPSAP08865 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPSAP08865 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPSAP08865 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPSAP08865 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPSAP08865 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPSAP08865 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RPSAP08865 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPSAP08865 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPSAP08865 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPSAP08865 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPSAP08865 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPSAP08865 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPSAP08865 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms