Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TPM2P07951 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TPM2P07951 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TPM2P07951 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TPM2P07951 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TPM2P07951 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TPM2P07951 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TPM2P07951 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TPM2P07951 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TPM2P07951 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TPM2P07951 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TPM2P07951 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TPM2P07951 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TPM2P07951 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TPM2P07951 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TPM2P07951 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TPM2P07951 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
TPM2P07951 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TPM2P07951 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TPM2P07951 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TPM2P07951 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TPM2P07951 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TPM2P07951 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TPM2P07951 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TPM2P07951 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TPM2P07951 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TPM2P07951 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TPM2P07951 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
TPM2P07951 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TPM2P07951 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TPM2P07951 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TPM2P07951 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TPM2P07951 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TPM2P07951 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TPM2P07951 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TPM2P07951 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TPM2P07951 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
TPM2P07951 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
TPM2P07951 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TPM2P07951 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TPM2P07951 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TPM2P07951 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TPM2P07951 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TPM2P07951 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TPM2P07951 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
TPM2P07951 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TPM2P07951 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TPM2P07951 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TPM2P07951 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TPM2P07951 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TPM2P07951 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TPM2P07951 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TPM2P07951 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
TPM2P07951 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TPM2P07951 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TPM2P07951 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TPM2P07951 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TPM2P07951 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TPM2P07951 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TPM2P07951 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TPM2P07951 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TPM2P07951 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TPM2P07951 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TPM2P07951 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TPM2P07951 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TPM2P07951 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TPM2P07951 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TPM2P07951 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TPM2P07951 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
TPM2P07951 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TPM2P07951 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TPM2P07951 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TPM2P07951 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
TPM2P07951 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TPM2P07951 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
TPM2P07951 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
TPM2P07951 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TPM2P07951 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
TPM2P07951 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TPM2P07951 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TPM2P07951 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TPM2P07951 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TPM2P07951 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TPM2P07951 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TPM2P07951 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TPM2P07951 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
TPM2P07951 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TPM2P07951 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TPM2P07951 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TPM2P07951 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TPM2P07951 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TPM2P07951 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TPM2P07951 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TPM2P07951 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TPM2P07951 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TPM2P07951 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
TPM2P07951 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TPM2P07951 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TPM2P07951 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TPM2P07951 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms