Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOC3P02656 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOC3P02656 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOC3P02656 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOC3P02656 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOC3P02656 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOC3P02656 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOC3P02656 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
APOC3P02656 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOC3P02656 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOC3P02656 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOC3P02656 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOC3P02656 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOC3P02656 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOC3P02656 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOC3P02656 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOC3P02656 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOC3P02656 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
APOC3P02656 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOC3P02656 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOC3P02656 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOC3P02656 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOC3P02656 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOC3P02656 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOC3P02656 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOC3P02656 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOC3P02656 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOC3P02656 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOC3P02656 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOC3P02656 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOC3P02656 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOC3P02656 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOC3P02656 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOC3P02656 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOC3P02656 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOC3P02656 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOC3P02656 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOC3P02656 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOC3P02656 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOC3P02656 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOC3P02656 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOC3P02656 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOC3P02656 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOC3P02656 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOC3P02656 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOC3P02656 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOC3P02656 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOC3P02656 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOC3P02656 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOC3P02656 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOC3P02656 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOC3P02656 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOC3P02656 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOC3P02656 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOC3P02656 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOC3P02656 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOC3P02656 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOC3P02656 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOC3P02656 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOC3P02656 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOC3P02656 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOC3P02656 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOC3P02656 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOC3P02656 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOC3P02656 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOC3P02656 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOC3P02656 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOC3P02656 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOC3P02656 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOC3P02656 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOC3P02656 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOC3P02656 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOC3P02656 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOC3P02656 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOC3P02656 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOC3P02656 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOC3P02656 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOC3P02656 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOC3P02656 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOC3P02656 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOC3P02656 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOC3P02656 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOC3P02656 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOC3P02656 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOC3P02656 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOC3P02656 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOC3P02656 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOC3P02656 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOC3P02656 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOC3P02656 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOC3P02656 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOC3P02656 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOC3P02656 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
APOC3P02656 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOC3P02656 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOC3P02656 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOC3P02656 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOC3P02656 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOC3P02656 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOC3P02656 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 345 ms