Protein–RNA interactions for Protein: P01583

IL1A, Interleukin-1 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1AP01583 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
IL1AP01583 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IL1AP01583 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
IL1AP01583 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IL1AP01583 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IL1AP01583 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IL1AP01583 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IL1AP01583 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IL1AP01583 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IL1AP01583 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IL1AP01583 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IL1AP01583 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IL1AP01583 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IL1AP01583 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IL1AP01583 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IL1AP01583 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IL1AP01583 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IL1AP01583 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
IL1AP01583 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IL1AP01583 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IL1AP01583 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IL1AP01583 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IL1AP01583 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IL1AP01583 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IL1AP01583 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
IL1AP01583 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IL1AP01583 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IL1AP01583 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IL1AP01583 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IL1AP01583 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IL1AP01583 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IL1AP01583 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IL1AP01583 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IL1AP01583 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IL1AP01583 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IL1AP01583 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IL1AP01583 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IL1AP01583 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IL1AP01583 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IL1AP01583 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IL1AP01583 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IL1AP01583 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IL1AP01583 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IL1AP01583 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IL1AP01583 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IL1AP01583 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IL1AP01583 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IL1AP01583 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IL1AP01583 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IL1AP01583 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IL1AP01583 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IL1AP01583 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IL1AP01583 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IL1AP01583 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IL1AP01583 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IL1AP01583 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IL1AP01583 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IL1AP01583 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IL1AP01583 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IL1AP01583 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IL1AP01583 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IL1AP01583 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IL1AP01583 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IL1AP01583 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
IL1AP01583 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
IL1AP01583 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IL1AP01583 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IL1AP01583 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IL1AP01583 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IL1AP01583 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IL1AP01583 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IL1AP01583 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IL1AP01583 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IL1AP01583 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IL1AP01583 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IL1AP01583 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IL1AP01583 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IL1AP01583 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IL1AP01583 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IL1AP01583 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
IL1AP01583 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IL1AP01583 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IL1AP01583 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IL1AP01583 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IL1AP01583 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IL1AP01583 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IL1AP01583 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IL1AP01583 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IL1AP01583 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IL1AP01583 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IL1AP01583 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IL1AP01583 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IL1AP01583 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IL1AP01583 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IL1AP01583 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IL1AP01583 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IL1AP01583 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IL1AP01583 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IL1AP01583 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IL1AP01583 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms