Protein–RNA interactions for Protein: P01009

SERPINA1, Alpha-1-antitrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA1P01009 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SERPINA1P01009 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SERPINA1P01009 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SERPINA1P01009 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SERPINA1P01009 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SERPINA1P01009 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SERPINA1P01009 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SERPINA1P01009 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SERPINA1P01009 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SERPINA1P01009 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SERPINA1P01009 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SERPINA1P01009 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SERPINA1P01009 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SERPINA1P01009 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SERPINA1P01009 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SERPINA1P01009 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SERPINA1P01009 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SERPINA1P01009 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SERPINA1P01009 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SERPINA1P01009 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SERPINA1P01009 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SERPINA1P01009 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SERPINA1P01009 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SERPINA1P01009 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SERPINA1P01009 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SERPINA1P01009 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SERPINA1P01009 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SERPINA1P01009 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SERPINA1P01009 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SERPINA1P01009 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SERPINA1P01009 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SERPINA1P01009 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SERPINA1P01009 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SERPINA1P01009 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SERPINA1P01009 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SERPINA1P01009 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SERPINA1P01009 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SERPINA1P01009 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SERPINA1P01009 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SERPINA1P01009 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SERPINA1P01009 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SERPINA1P01009 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SERPINA1P01009 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SERPINA1P01009 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SERPINA1P01009 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SERPINA1P01009 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SERPINA1P01009 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SERPINA1P01009 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SERPINA1P01009 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SERPINA1P01009 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SERPINA1P01009 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SERPINA1P01009 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SERPINA1P01009 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SERPINA1P01009 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SERPINA1P01009 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SERPINA1P01009 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SERPINA1P01009 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SERPINA1P01009 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SERPINA1P01009 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SERPINA1P01009 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SERPINA1P01009 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SERPINA1P01009 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SERPINA1P01009 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SERPINA1P01009 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SERPINA1P01009 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SERPINA1P01009 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SERPINA1P01009 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SERPINA1P01009 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SERPINA1P01009 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SERPINA1P01009 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SERPINA1P01009 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SERPINA1P01009 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SERPINA1P01009 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SERPINA1P01009 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SERPINA1P01009 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SERPINA1P01009 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SERPINA1P01009 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SERPINA1P01009 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SERPINA1P01009 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SERPINA1P01009 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SERPINA1P01009 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SERPINA1P01009 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SERPINA1P01009 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SERPINA1P01009 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SERPINA1P01009 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SERPINA1P01009 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SERPINA1P01009 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SERPINA1P01009 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SERPINA1P01009 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SERPINA1P01009 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SERPINA1P01009 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SERPINA1P01009 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SERPINA1P01009 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SERPINA1P01009 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SERPINA1P01009 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SERPINA1P01009 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SERPINA1P01009 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SERPINA1P01009 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SERPINA1P01009 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SERPINA1P01009 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms