Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYF2O95926 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYF2O95926 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYF2O95926 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYF2O95926 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYF2O95926 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYF2O95926 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYF2O95926 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYF2O95926 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SYF2O95926 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SYF2O95926 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYF2O95926 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYF2O95926 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYF2O95926 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYF2O95926 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYF2O95926 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYF2O95926 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYF2O95926 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYF2O95926 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYF2O95926 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYF2O95926 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYF2O95926 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYF2O95926 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYF2O95926 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYF2O95926 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYF2O95926 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYF2O95926 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYF2O95926 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYF2O95926 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYF2O95926 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYF2O95926 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYF2O95926 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SYF2O95926 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SYF2O95926 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYF2O95926 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYF2O95926 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYF2O95926 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYF2O95926 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYF2O95926 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYF2O95926 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYF2O95926 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYF2O95926 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYF2O95926 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYF2O95926 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYF2O95926 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYF2O95926 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYF2O95926 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYF2O95926 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYF2O95926 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYF2O95926 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYF2O95926 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYF2O95926 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYF2O95926 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYF2O95926 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYF2O95926 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYF2O95926 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYF2O95926 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYF2O95926 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
SYF2O95926 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYF2O95926 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYF2O95926 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYF2O95926 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYF2O95926 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYF2O95926 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYF2O95926 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYF2O95926 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYF2O95926 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYF2O95926 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYF2O95926 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYF2O95926 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYF2O95926 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYF2O95926 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYF2O95926 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYF2O95926 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYF2O95926 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SYF2O95926 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYF2O95926 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYF2O95926 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYF2O95926 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
SYF2O95926 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYF2O95926 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYF2O95926 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYF2O95926 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYF2O95926 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYF2O95926 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYF2O95926 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SYF2O95926 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SYF2O95926 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYF2O95926 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYF2O95926 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYF2O95926 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYF2O95926 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYF2O95926 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SYF2O95926 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYF2O95926 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYF2O95926 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYF2O95926 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYF2O95926 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SYF2O95926 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYF2O95926 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms