Protein–RNA interactions for Protein: O95807

TMEM50A, Transmembrane protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM50AO95807 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM50AO95807 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM50AO95807 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM50AO95807 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM50AO95807 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM50AO95807 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM50AO95807 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM50AO95807 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM50AO95807 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM50AO95807 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM50AO95807 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM50AO95807 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM50AO95807 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM50AO95807 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM50AO95807 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM50AO95807 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM50AO95807 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM50AO95807 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM50AO95807 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM50AO95807 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM50AO95807 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM50AO95807 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM50AO95807 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM50AO95807 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM50AO95807 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM50AO95807 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM50AO95807 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM50AO95807 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM50AO95807 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM50AO95807 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM50AO95807 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM50AO95807 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM50AO95807 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM50AO95807 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM50AO95807 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM50AO95807 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM50AO95807 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM50AO95807 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM50AO95807 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM50AO95807 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM50AO95807 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM50AO95807 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM50AO95807 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM50AO95807 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM50AO95807 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM50AO95807 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM50AO95807 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM50AO95807 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM50AO95807 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM50AO95807 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM50AO95807 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM50AO95807 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM50AO95807 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM50AO95807 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM50AO95807 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM50AO95807 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM50AO95807 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM50AO95807 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM50AO95807 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM50AO95807 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM50AO95807 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM50AO95807 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM50AO95807 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM50AO95807 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM50AO95807 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM50AO95807 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM50AO95807 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM50AO95807 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM50AO95807 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM50AO95807 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM50AO95807 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM50AO95807 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM50AO95807 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM50AO95807 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM50AO95807 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM50AO95807 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM50AO95807 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM50AO95807 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM50AO95807 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM50AO95807 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM50AO95807 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM50AO95807 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM50AO95807 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM50AO95807 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM50AO95807 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM50AO95807 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM50AO95807 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM50AO95807 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM50AO95807 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM50AO95807 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM50AO95807 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM50AO95807 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM50AO95807 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM50AO95807 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM50AO95807 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM50AO95807 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM50AO95807 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM50AO95807 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM50AO95807 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM50AO95807 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms