Protein–RNA interactions for Protein: O75954

TSPAN9, Tetraspanin-9, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN9O75954 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSPAN9O75954 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSPAN9O75954 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN9O75954 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN9O75954 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN9O75954 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN9O75954 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSPAN9O75954 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSPAN9O75954 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN9O75954 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN9O75954 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN9O75954 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN9O75954 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN9O75954 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN9O75954 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN9O75954 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN9O75954 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN9O75954 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSPAN9O75954 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN9O75954 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN9O75954 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN9O75954 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN9O75954 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN9O75954 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN9O75954 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN9O75954 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN9O75954 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN9O75954 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN9O75954 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN9O75954 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN9O75954 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN9O75954 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN9O75954 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TSPAN9O75954 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TSPAN9O75954 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN9O75954 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN9O75954 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN9O75954 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN9O75954 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN9O75954 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN9O75954 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN9O75954 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN9O75954 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN9O75954 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN9O75954 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN9O75954 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN9O75954 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN9O75954 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN9O75954 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN9O75954 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TSPAN9O75954 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN9O75954 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN9O75954 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN9O75954 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN9O75954 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN9O75954 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN9O75954 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN9O75954 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN9O75954 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN9O75954 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN9O75954 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN9O75954 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN9O75954 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN9O75954 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN9O75954 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN9O75954 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN9O75954 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN9O75954 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN9O75954 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN9O75954 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN9O75954 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN9O75954 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN9O75954 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN9O75954 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN9O75954 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN9O75954 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN9O75954 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN9O75954 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN9O75954 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN9O75954 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN9O75954 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN9O75954 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN9O75954 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN9O75954 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN9O75954 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN9O75954 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN9O75954 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN9O75954 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN9O75954 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN9O75954 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN9O75954 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN9O75954 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN9O75954 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN9O75954 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TSPAN9O75954 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN9O75954 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN9O75954 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN9O75954 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN9O75954 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN9O75954 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms