Protein–RNA interactions for Protein: O75063

FAM20B, Glycosaminoglycan xylosylkinase, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20BO75063 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM20BO75063 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM20BO75063 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM20BO75063 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM20BO75063 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM20BO75063 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM20BO75063 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM20BO75063 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM20BO75063 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM20BO75063 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM20BO75063 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM20BO75063 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM20BO75063 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM20BO75063 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM20BO75063 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM20BO75063 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM20BO75063 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM20BO75063 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM20BO75063 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM20BO75063 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM20BO75063 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
FAM20BO75063 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FAM20BO75063 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM20BO75063 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM20BO75063 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM20BO75063 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM20BO75063 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM20BO75063 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM20BO75063 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM20BO75063 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM20BO75063 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM20BO75063 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM20BO75063 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM20BO75063 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM20BO75063 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM20BO75063 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM20BO75063 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM20BO75063 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM20BO75063 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM20BO75063 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM20BO75063 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM20BO75063 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM20BO75063 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM20BO75063 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM20BO75063 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM20BO75063 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM20BO75063 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM20BO75063 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM20BO75063 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM20BO75063 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM20BO75063 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM20BO75063 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM20BO75063 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM20BO75063 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM20BO75063 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM20BO75063 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM20BO75063 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM20BO75063 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM20BO75063 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM20BO75063 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM20BO75063 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM20BO75063 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM20BO75063 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM20BO75063 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM20BO75063 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM20BO75063 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM20BO75063 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM20BO75063 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM20BO75063 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM20BO75063 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM20BO75063 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM20BO75063 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM20BO75063 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
FAM20BO75063 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
FAM20BO75063 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM20BO75063 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM20BO75063 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM20BO75063 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM20BO75063 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM20BO75063 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM20BO75063 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM20BO75063 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM20BO75063 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM20BO75063 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM20BO75063 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM20BO75063 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM20BO75063 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM20BO75063 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM20BO75063 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM20BO75063 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM20BO75063 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM20BO75063 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM20BO75063 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM20BO75063 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM20BO75063 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
FAM20BO75063 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FAM20BO75063 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM20BO75063 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM20BO75063 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM20BO75063 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms