Protein–RNA interactions for Protein: O60936

NOL3, Nucleolar protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOL3O60936 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NOL3O60936 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NOL3O60936 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NOL3O60936 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NOL3O60936 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NOL3O60936 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NOL3O60936 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NOL3O60936 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NOL3O60936 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NOL3O60936 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NOL3O60936 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NOL3O60936 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NOL3O60936 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NOL3O60936 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NOL3O60936 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NOL3O60936 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NOL3O60936 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NOL3O60936 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NOL3O60936 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NOL3O60936 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NOL3O60936 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NOL3O60936 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NOL3O60936 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NOL3O60936 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NOL3O60936 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NOL3O60936 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOL3O60936 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOL3O60936 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NOL3O60936 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NOL3O60936 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOL3O60936 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOL3O60936 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOL3O60936 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOL3O60936 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOL3O60936 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NOL3O60936 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NOL3O60936 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NOL3O60936 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOL3O60936 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOL3O60936 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOL3O60936 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NOL3O60936 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOL3O60936 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOL3O60936 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOL3O60936 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOL3O60936 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOL3O60936 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NOL3O60936 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOL3O60936 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOL3O60936 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOL3O60936 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOL3O60936 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOL3O60936 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOL3O60936 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOL3O60936 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOL3O60936 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOL3O60936 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOL3O60936 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOL3O60936 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NOL3O60936 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOL3O60936 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NOL3O60936 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NOL3O60936 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOL3O60936 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOL3O60936 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOL3O60936 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOL3O60936 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOL3O60936 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOL3O60936 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOL3O60936 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOL3O60936 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOL3O60936 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOL3O60936 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOL3O60936 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOL3O60936 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOL3O60936 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOL3O60936 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOL3O60936 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOL3O60936 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOL3O60936 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NOL3O60936 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOL3O60936 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOL3O60936 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOL3O60936 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOL3O60936 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOL3O60936 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOL3O60936 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOL3O60936 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOL3O60936 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOL3O60936 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOL3O60936 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NOL3O60936 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NOL3O60936 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NOL3O60936 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NOL3O60936 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NOL3O60936 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOL3O60936 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOL3O60936 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOL3O60936 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOL3O60936 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.3 ms