Protein–RNA interactions for Protein: O60548

FOXD2, Forkhead box protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD2O60548 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXD2O60548 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FOXD2O60548 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FOXD2O60548 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
FOXD2O60548 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FOXD2O60548 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOXD2O60548 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXD2O60548 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXD2O60548 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOXD2O60548 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOXD2O60548 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FOXD2O60548 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FOXD2O60548 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FOXD2O60548 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FOXD2O60548 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FOXD2O60548 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FOXD2O60548 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOXD2O60548 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
FOXD2O60548 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOXD2O60548 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FOXD2O60548 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FOXD2O60548 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FOXD2O60548 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
FOXD2O60548 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FOXD2O60548 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FOXD2O60548 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FOXD2O60548 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOXD2O60548 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOXD2O60548 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FOXD2O60548 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FOXD2O60548 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
FOXD2O60548 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FOXD2O60548 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
FOXD2O60548 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FOXD2O60548 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FOXD2O60548 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FOXD2O60548 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
FOXD2O60548 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FOXD2O60548 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FOXD2O60548 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FOXD2O60548 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FOXD2O60548 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FOXD2O60548 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FOXD2O60548 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FOXD2O60548 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FOXD2O60548 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FOXD2O60548 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FOXD2O60548 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FOXD2O60548 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FOXD2O60548 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FOXD2O60548 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FOXD2O60548 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOXD2O60548 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXD2O60548 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXD2O60548 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
FOXD2O60548 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
FOXD2O60548 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FOXD2O60548 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXD2O60548 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOXD2O60548 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FOXD2O60548 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FOXD2O60548 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
FOXD2O60548 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
FOXD2O60548 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FOXD2O60548 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FOXD2O60548 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FOXD2O60548 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FOXD2O60548 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FOXD2O60548 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
FOXD2O60548 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FOXD2O60548 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FOXD2O60548 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FOXD2O60548 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FOXD2O60548 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FOXD2O60548 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
FOXD2O60548 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FOXD2O60548 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FOXD2O60548 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FOXD2O60548 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXD2O60548 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXD2O60548 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXD2O60548 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXD2O60548 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXD2O60548 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXD2O60548 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FOXD2O60548 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXD2O60548 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FOXD2O60548 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FOXD2O60548 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FOXD2O60548 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FOXD2O60548 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FOXD2O60548 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FOXD2O60548 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXD2O60548 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXD2O60548 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXD2O60548 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FOXD2O60548 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXD2O60548 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXD2O60548 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXD2O60548 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms